Protein–RNA interactions for Protein: Q6A0D4

Rftn1, Raftlin, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rftn1Q6A0D4 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rftn1Q6A0D4 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rftn1Q6A0D4 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rftn1Q6A0D4 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rftn1Q6A0D4 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rftn1Q6A0D4 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rftn1Q6A0D4 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rftn1Q6A0D4 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rftn1Q6A0D4 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rftn1Q6A0D4 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rftn1Q6A0D4 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rftn1Q6A0D4 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rftn1Q6A0D4 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rftn1Q6A0D4 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rftn1Q6A0D4 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rftn1Q6A0D4 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rftn1Q6A0D4 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rftn1Q6A0D4 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rftn1Q6A0D4 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rftn1Q6A0D4 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rftn1Q6A0D4 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rftn1Q6A0D4 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rftn1Q6A0D4 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rftn1Q6A0D4 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rftn1Q6A0D4 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rftn1Q6A0D4 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rftn1Q6A0D4 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rftn1Q6A0D4 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rftn1Q6A0D4 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rftn1Q6A0D4 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rftn1Q6A0D4 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rftn1Q6A0D4 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rftn1Q6A0D4 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rftn1Q6A0D4 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rftn1Q6A0D4 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rftn1Q6A0D4 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rftn1Q6A0D4 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rftn1Q6A0D4 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rftn1Q6A0D4 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rftn1Q6A0D4 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rftn1Q6A0D4 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Rftn1Q6A0D4 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rftn1Q6A0D4 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Rftn1Q6A0D4 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rftn1Q6A0D4 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rftn1Q6A0D4 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Rftn1Q6A0D4 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Rftn1Q6A0D4 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Rftn1Q6A0D4 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Rftn1Q6A0D4 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Rftn1Q6A0D4 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Rftn1Q6A0D4 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Rftn1Q6A0D4 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Rftn1Q6A0D4 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rftn1Q6A0D4 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Rftn1Q6A0D4 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Rftn1Q6A0D4 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Rftn1Q6A0D4 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Rftn1Q6A0D4 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Rftn1Q6A0D4 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Rftn1Q6A0D4 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rftn1Q6A0D4 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rftn1Q6A0D4 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Rftn1Q6A0D4 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rftn1Q6A0D4 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rftn1Q6A0D4 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rftn1Q6A0D4 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Rftn1Q6A0D4 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Rftn1Q6A0D4 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rftn1Q6A0D4 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Rftn1Q6A0D4 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rftn1Q6A0D4 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rftn1Q6A0D4 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rftn1Q6A0D4 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rftn1Q6A0D4 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rftn1Q6A0D4 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rftn1Q6A0D4 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Rftn1Q6A0D4 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rftn1Q6A0D4 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rftn1Q6A0D4 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Rftn1Q6A0D4 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rftn1Q6A0D4 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rftn1Q6A0D4 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rftn1Q6A0D4 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rftn1Q6A0D4 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rftn1Q6A0D4 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rftn1Q6A0D4 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rftn1Q6A0D4 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rftn1Q6A0D4 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rftn1Q6A0D4 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rftn1Q6A0D4 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rftn1Q6A0D4 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rftn1Q6A0D4 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rftn1Q6A0D4 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rftn1Q6A0D4 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rftn1Q6A0D4 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rftn1Q6A0D4 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rftn1Q6A0D4 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Rftn1Q6A0D4 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rftn1Q6A0D4 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms