Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

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Length 1,063 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Pdzrn3Q69ZS0 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Pdzrn3Q69ZS0 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Pdzrn3Q69ZS0 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Pdzrn3Q69ZS0 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Pdzrn3Q69ZS0 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Pdzrn3Q69ZS0 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Pdzrn3Q69ZS0 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Pdzrn3Q69ZS0 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Pdzrn3Q69ZS0 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Pdzrn3Q69ZS0 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Pdzrn3Q69ZS0 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Pdzrn3Q69ZS0 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Pdzrn3Q69ZS0 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Pdzrn3Q69ZS0 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Pdzrn3Q69ZS0 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Pdzrn3Q69ZS0 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Pdzrn3Q69ZS0 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Pdzrn3Q69ZS0 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Pdzrn3Q69ZS0 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Pdzrn3Q69ZS0 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Pdzrn3Q69ZS0 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Pdzrn3Q69ZS0 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Pdzrn3Q69ZS0 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Pdzrn3Q69ZS0 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pdzrn3Q69ZS0 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pdzrn3Q69ZS0 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pdzrn3Q69ZS0 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pdzrn3Q69ZS0 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pdzrn3Q69ZS0 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pdzrn3Q69ZS0 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pdzrn3Q69ZS0 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pdzrn3Q69ZS0 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pdzrn3Q69ZS0 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Pdzrn3Q69ZS0 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pdzrn3Q69ZS0 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pdzrn3Q69ZS0 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pdzrn3Q69ZS0 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pdzrn3Q69ZS0 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pdzrn3Q69ZS0 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pdzrn3Q69ZS0 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pdzrn3Q69ZS0 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pdzrn3Q69ZS0 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pdzrn3Q69ZS0 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pdzrn3Q69ZS0 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pdzrn3Q69ZS0 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pdzrn3Q69ZS0 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pdzrn3Q69ZS0 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pdzrn3Q69ZS0 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pdzrn3Q69ZS0 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pdzrn3Q69ZS0 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pdzrn3Q69ZS0 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pdzrn3Q69ZS0 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pdzrn3Q69ZS0 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pdzrn3Q69ZS0 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pdzrn3Q69ZS0 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pdzrn3Q69ZS0 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pdzrn3Q69ZS0 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pdzrn3Q69ZS0 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pdzrn3Q69ZS0 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pdzrn3Q69ZS0 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pdzrn3Q69ZS0 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pdzrn3Q69ZS0 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pdzrn3Q69ZS0 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pdzrn3Q69ZS0 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pdzrn3Q69ZS0 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pdzrn3Q69ZS0 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pdzrn3Q69ZS0 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
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Pdzrn3Q69ZS0 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Pdzrn3Q69ZS0 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pdzrn3Q69ZS0 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pdzrn3Q69ZS0 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pdzrn3Q69ZS0 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pdzrn3Q69ZS0 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pdzrn3Q69ZS0 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pdzrn3Q69ZS0 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
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Pdzrn3Q69ZS0 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pdzrn3Q69ZS0 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pdzrn3Q69ZS0 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pdzrn3Q69ZS0 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Pdzrn3Q69ZS0 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pdzrn3Q69ZS0 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pdzrn3Q69ZS0 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pdzrn3Q69ZS0 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pdzrn3Q69ZS0 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pdzrn3Q69ZS0 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pdzrn3Q69ZS0 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Pdzrn3Q69ZS0 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pdzrn3Q69ZS0 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pdzrn3Q69ZS0 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pdzrn3Q69ZS0 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pdzrn3Q69ZS0 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pdzrn3Q69ZS0 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pdzrn3Q69ZS0 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pdzrn3Q69ZS0 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pdzrn3Q69ZS0 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pdzrn3Q69ZS0 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
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