Protein–RNA interactions for Protein: Q68EF0

Rab3ip, Rab-3A-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3ipQ68EF0 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab3ipQ68EF0 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab3ipQ68EF0 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab3ipQ68EF0 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab3ipQ68EF0 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab3ipQ68EF0 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab3ipQ68EF0 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab3ipQ68EF0 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rab3ipQ68EF0 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rab3ipQ68EF0 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rab3ipQ68EF0 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rab3ipQ68EF0 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rab3ipQ68EF0 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rab3ipQ68EF0 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab3ipQ68EF0 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab3ipQ68EF0 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab3ipQ68EF0 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab3ipQ68EF0 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rab3ipQ68EF0 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab3ipQ68EF0 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Rab3ipQ68EF0 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Rab3ipQ68EF0 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Rab3ipQ68EF0 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab3ipQ68EF0 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rab3ipQ68EF0 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab3ipQ68EF0 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab3ipQ68EF0 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab3ipQ68EF0 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab3ipQ68EF0 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rab3ipQ68EF0 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab3ipQ68EF0 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab3ipQ68EF0 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab3ipQ68EF0 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab3ipQ68EF0 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab3ipQ68EF0 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Rab3ipQ68EF0 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab3ipQ68EF0 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rab3ipQ68EF0 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab3ipQ68EF0 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rab3ipQ68EF0 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab3ipQ68EF0 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab3ipQ68EF0 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab3ipQ68EF0 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rab3ipQ68EF0 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rab3ipQ68EF0 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rab3ipQ68EF0 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rab3ipQ68EF0 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab3ipQ68EF0 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab3ipQ68EF0 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab3ipQ68EF0 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab3ipQ68EF0 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rab3ipQ68EF0 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab3ipQ68EF0 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab3ipQ68EF0 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rab3ipQ68EF0 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab3ipQ68EF0 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rab3ipQ68EF0 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Rab3ipQ68EF0 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab3ipQ68EF0 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rab3ipQ68EF0 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Rab3ipQ68EF0 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rab3ipQ68EF0 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rab3ipQ68EF0 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab3ipQ68EF0 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab3ipQ68EF0 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab3ipQ68EF0 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab3ipQ68EF0 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab3ipQ68EF0 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab3ipQ68EF0 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab3ipQ68EF0 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab3ipQ68EF0 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rab3ipQ68EF0 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab3ipQ68EF0 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab3ipQ68EF0 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab3ipQ68EF0 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab3ipQ68EF0 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab3ipQ68EF0 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Rab3ipQ68EF0 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Rab3ipQ68EF0 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab3ipQ68EF0 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Rab3ipQ68EF0 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Rab3ipQ68EF0 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Rab3ipQ68EF0 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Rab3ipQ68EF0 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab3ipQ68EF0 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab3ipQ68EF0 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab3ipQ68EF0 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rab3ipQ68EF0 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Rab3ipQ68EF0 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab3ipQ68EF0 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rab3ipQ68EF0 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab3ipQ68EF0 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab3ipQ68EF0 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab3ipQ68EF0 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab3ipQ68EF0 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rab3ipQ68EF0 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab3ipQ68EF0 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab3ipQ68EF0 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rab3ipQ68EF0 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab3ipQ68EF0 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms