Protein–RNA interactions for Protein: Q689Z5

Sbno1, Protein strawberry notch homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno1Q689Z5 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sbno1Q689Z5 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sbno1Q689Z5 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sbno1Q689Z5 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sbno1Q689Z5 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sbno1Q689Z5 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sbno1Q689Z5 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sbno1Q689Z5 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sbno1Q689Z5 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sbno1Q689Z5 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sbno1Q689Z5 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sbno1Q689Z5 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sbno1Q689Z5 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sbno1Q689Z5 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Sbno1Q689Z5 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Sbno1Q689Z5 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Sbno1Q689Z5 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Sbno1Q689Z5 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Sbno1Q689Z5 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Sbno1Q689Z5 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sbno1Q689Z5 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sbno1Q689Z5 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sbno1Q689Z5 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sbno1Q689Z5 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sbno1Q689Z5 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sbno1Q689Z5 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sbno1Q689Z5 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sbno1Q689Z5 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sbno1Q689Z5 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sbno1Q689Z5 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sbno1Q689Z5 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sbno1Q689Z5 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Sbno1Q689Z5 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sbno1Q689Z5 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sbno1Q689Z5 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
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Sbno1Q689Z5 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
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Sbno1Q689Z5 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sbno1Q689Z5 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sbno1Q689Z5 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sbno1Q689Z5 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
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Sbno1Q689Z5 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sbno1Q689Z5 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sbno1Q689Z5 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sbno1Q689Z5 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sbno1Q689Z5 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sbno1Q689Z5 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
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Sbno1Q689Z5 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
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Sbno1Q689Z5 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sbno1Q689Z5 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sbno1Q689Z5 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sbno1Q689Z5 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
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Sbno1Q689Z5 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sbno1Q689Z5 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sbno1Q689Z5 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sbno1Q689Z5 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sbno1Q689Z5 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sbno1Q689Z5 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sbno1Q689Z5 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sbno1Q689Z5 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sbno1Q689Z5 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sbno1Q689Z5 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sbno1Q689Z5 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sbno1Q689Z5 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sbno1Q689Z5 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sbno1Q689Z5 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sbno1Q689Z5 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sbno1Q689Z5 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sbno1Q689Z5 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sbno1Q689Z5 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sbno1Q689Z5 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sbno1Q689Z5 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sbno1Q689Z5 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sbno1Q689Z5 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sbno1Q689Z5 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sbno1Q689Z5 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sbno1Q689Z5 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
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