Protein–RNA interactions for Protein: Q64127

Trim24, Transcription intermediary factor 1-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim24Q64127 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim24Q64127 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim24Q64127 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim24Q64127 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim24Q64127 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim24Q64127 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim24Q64127 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim24Q64127 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim24Q64127 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim24Q64127 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim24Q64127 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim24Q64127 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim24Q64127 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim24Q64127 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim24Q64127 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim24Q64127 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim24Q64127 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim24Q64127 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim24Q64127 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim24Q64127 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim24Q64127 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim24Q64127 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim24Q64127 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim24Q64127 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim24Q64127 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim24Q64127 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim24Q64127 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim24Q64127 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim24Q64127 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim24Q64127 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim24Q64127 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim24Q64127 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim24Q64127 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim24Q64127 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim24Q64127 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim24Q64127 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim24Q64127 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim24Q64127 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim24Q64127 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim24Q64127 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim24Q64127 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim24Q64127 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim24Q64127 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim24Q64127 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim24Q64127 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim24Q64127 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim24Q64127 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim24Q64127 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim24Q64127 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim24Q64127 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim24Q64127 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim24Q64127 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim24Q64127 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim24Q64127 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim24Q64127 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim24Q64127 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim24Q64127 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim24Q64127 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim24Q64127 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim24Q64127 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim24Q64127 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim24Q64127 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim24Q64127 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim24Q64127 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim24Q64127 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim24Q64127 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim24Q64127 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim24Q64127 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Trim24Q64127 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim24Q64127 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim24Q64127 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim24Q64127 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim24Q64127 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim24Q64127 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim24Q64127 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim24Q64127 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim24Q64127 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim24Q64127 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim24Q64127 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim24Q64127 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim24Q64127 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim24Q64127 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim24Q64127 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim24Q64127 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim24Q64127 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim24Q64127 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim24Q64127 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim24Q64127 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim24Q64127 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim24Q64127 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim24Q64127 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim24Q64127 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim24Q64127 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim24Q64127 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim24Q64127 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim24Q64127 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim24Q64127 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim24Q64127 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms