Protein–RNA interactions for Protein: Q63934

Pou4f2, POU domain, class 4, transcription factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f2Q63934 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Pou4f2Q63934 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pou4f2Q63934 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pou4f2Q63934 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pou4f2Q63934 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pou4f2Q63934 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pou4f2Q63934 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pou4f2Q63934 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pou4f2Q63934 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pou4f2Q63934 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pou4f2Q63934 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pou4f2Q63934 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pou4f2Q63934 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pou4f2Q63934 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pou4f2Q63934 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pou4f2Q63934 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pou4f2Q63934 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pou4f2Q63934 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pou4f2Q63934 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pou4f2Q63934 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pou4f2Q63934 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pou4f2Q63934 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pou4f2Q63934 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pou4f2Q63934 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pou4f2Q63934 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pou4f2Q63934 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pou4f2Q63934 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pou4f2Q63934 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pou4f2Q63934 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pou4f2Q63934 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pou4f2Q63934 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pou4f2Q63934 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pou4f2Q63934 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pou4f2Q63934 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pou4f2Q63934 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pou4f2Q63934 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pou4f2Q63934 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pou4f2Q63934 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pou4f2Q63934 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pou4f2Q63934 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pou4f2Q63934 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pou4f2Q63934 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pou4f2Q63934 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pou4f2Q63934 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pou4f2Q63934 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pou4f2Q63934 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pou4f2Q63934 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pou4f2Q63934 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pou4f2Q63934 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pou4f2Q63934 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pou4f2Q63934 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pou4f2Q63934 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pou4f2Q63934 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pou4f2Q63934 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pou4f2Q63934 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pou4f2Q63934 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pou4f2Q63934 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pou4f2Q63934 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pou4f2Q63934 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pou4f2Q63934 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pou4f2Q63934 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pou4f2Q63934 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pou4f2Q63934 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pou4f2Q63934 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pou4f2Q63934 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pou4f2Q63934 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pou4f2Q63934 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pou4f2Q63934 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pou4f2Q63934 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pou4f2Q63934 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pou4f2Q63934 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pou4f2Q63934 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pou4f2Q63934 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pou4f2Q63934 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pou4f2Q63934 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pou4f2Q63934 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pou4f2Q63934 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pou4f2Q63934 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pou4f2Q63934 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pou4f2Q63934 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pou4f2Q63934 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pou4f2Q63934 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pou4f2Q63934 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pou4f2Q63934 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pou4f2Q63934 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pou4f2Q63934 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pou4f2Q63934 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pou4f2Q63934 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pou4f2Q63934 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pou4f2Q63934 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pou4f2Q63934 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pou4f2Q63934 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pou4f2Q63934 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pou4f2Q63934 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pou4f2Q63934 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pou4f2Q63934 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pou4f2Q63934 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pou4f2Q63934 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pou4f2Q63934 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pou4f2Q63934 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms