Protein–RNA interactions for Protein: Q62559

Ift52, Intraflagellar transport protein 52 homolog, mousemouse

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Length 426 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift52Q62559 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ift52Q62559 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ift52Q62559 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ift52Q62559 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ift52Q62559 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ift52Q62559 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ift52Q62559 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ift52Q62559 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ift52Q62559 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ift52Q62559 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ift52Q62559 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ift52Q62559 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ift52Q62559 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ift52Q62559 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ift52Q62559 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ift52Q62559 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ift52Q62559 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ift52Q62559 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ift52Q62559 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ift52Q62559 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ift52Q62559 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ift52Q62559 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ift52Q62559 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ift52Q62559 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ift52Q62559 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ift52Q62559 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ift52Q62559 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ift52Q62559 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ift52Q62559 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ift52Q62559 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ift52Q62559 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ift52Q62559 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ift52Q62559 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ift52Q62559 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ift52Q62559 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
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Ift52Q62559 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ift52Q62559 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ift52Q62559 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ift52Q62559 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ift52Q62559 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ift52Q62559 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ift52Q62559 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ift52Q62559 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ift52Q62559 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ift52Q62559 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ift52Q62559 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ift52Q62559 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ift52Q62559 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ift52Q62559 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Ift52Q62559 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Ift52Q62559 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Ift52Q62559 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ift52Q62559 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ift52Q62559 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ift52Q62559 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ift52Q62559 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ift52Q62559 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ift52Q62559 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Ift52Q62559 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ift52Q62559 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ift52Q62559 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ift52Q62559 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ift52Q62559 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ift52Q62559 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ift52Q62559 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ift52Q62559 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ift52Q62559 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ift52Q62559 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ift52Q62559 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ift52Q62559 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ift52Q62559 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ift52Q62559 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ift52Q62559 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ift52Q62559 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ift52Q62559 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ift52Q62559 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ift52Q62559 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ift52Q62559 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ift52Q62559 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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