Protein–RNA interactions for Protein: Q62425

Ndufa4, Cytochrome c oxidase subunit NDUFA4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 82 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufa4Q62425 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ndufa4Q62425 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
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