Protein–RNA interactions for Protein: Q62424

Hoxa13, Homeobox protein Hox-A13, mousemouse

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Length 386 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa13Q62424 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxa13Q62424 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxa13Q62424 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxa13Q62424 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxa13Q62424 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxa13Q62424 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxa13Q62424 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxa13Q62424 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxa13Q62424 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxa13Q62424 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxa13Q62424 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxa13Q62424 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxa13Q62424 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxa13Q62424 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxa13Q62424 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxa13Q62424 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxa13Q62424 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxa13Q62424 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxa13Q62424 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxa13Q62424 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxa13Q62424 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxa13Q62424 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxa13Q62424 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxa13Q62424 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxa13Q62424 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxa13Q62424 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxa13Q62424 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxa13Q62424 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxa13Q62424 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxa13Q62424 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxa13Q62424 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxa13Q62424 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxa13Q62424 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxa13Q62424 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxa13Q62424 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxa13Q62424 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxa13Q62424 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxa13Q62424 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxa13Q62424 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxa13Q62424 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxa13Q62424 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxa13Q62424 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxa13Q62424 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxa13Q62424 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxa13Q62424 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxa13Q62424 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxa13Q62424 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxa13Q62424 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxa13Q62424 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxa13Q62424 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxa13Q62424 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxa13Q62424 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxa13Q62424 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxa13Q62424 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxa13Q62424 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxa13Q62424 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxa13Q62424 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxa13Q62424 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxa13Q62424 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxa13Q62424 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxa13Q62424 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxa13Q62424 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxa13Q62424 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxa13Q62424 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxa13Q62424 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxa13Q62424 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxa13Q62424 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxa13Q62424 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxa13Q62424 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxa13Q62424 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxa13Q62424 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxa13Q62424 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxa13Q62424 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxa13Q62424 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxa13Q62424 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxa13Q62424 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxa13Q62424 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxa13Q62424 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxa13Q62424 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxa13Q62424 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxa13Q62424 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxa13Q62424 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxa13Q62424 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxa13Q62424 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxa13Q62424 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hoxa13Q62424 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hoxa13Q62424 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxa13Q62424 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxa13Q62424 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxa13Q62424 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxa13Q62424 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxa13Q62424 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxa13Q62424 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxa13Q62424 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxa13Q62424 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxa13Q62424 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxa13Q62424 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxa13Q62424 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxa13Q62424 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxa13Q62424 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
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