Protein–RNA interactions for Protein: Q62393

Tpd52, Tumor protein D52, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpd52Q62393 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tpd52Q62393 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tpd52Q62393 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tpd52Q62393 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tpd52Q62393 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tpd52Q62393 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tpd52Q62393 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tpd52Q62393 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Tpd52Q62393 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Tpd52Q62393 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tpd52Q62393 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tpd52Q62393 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tpd52Q62393 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tpd52Q62393 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tpd52Q62393 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tpd52Q62393 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tpd52Q62393 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tpd52Q62393 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tpd52Q62393 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tpd52Q62393 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tpd52Q62393 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tpd52Q62393 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tpd52Q62393 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tpd52Q62393 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tpd52Q62393 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tpd52Q62393 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Tpd52Q62393 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tpd52Q62393 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tpd52Q62393 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tpd52Q62393 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tpd52Q62393 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tpd52Q62393 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tpd52Q62393 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tpd52Q62393 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tpd52Q62393 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tpd52Q62393 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tpd52Q62393 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tpd52Q62393 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tpd52Q62393 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tpd52Q62393 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tpd52Q62393 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tpd52Q62393 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tpd52Q62393 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tpd52Q62393 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tpd52Q62393 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tpd52Q62393 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tpd52Q62393 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tpd52Q62393 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tpd52Q62393 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tpd52Q62393 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tpd52Q62393 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tpd52Q62393 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tpd52Q62393 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Tpd52Q62393 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tpd52Q62393 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tpd52Q62393 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tpd52Q62393 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tpd52Q62393 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tpd52Q62393 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tpd52Q62393 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tpd52Q62393 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tpd52Q62393 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tpd52Q62393 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tpd52Q62393 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tpd52Q62393 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tpd52Q62393 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tpd52Q62393 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tpd52Q62393 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tpd52Q62393 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tpd52Q62393 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tpd52Q62393 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tpd52Q62393 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tpd52Q62393 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tpd52Q62393 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tpd52Q62393 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Tpd52Q62393 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Tpd52Q62393 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tpd52Q62393 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tpd52Q62393 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tpd52Q62393 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tpd52Q62393 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tpd52Q62393 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tpd52Q62393 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tpd52Q62393 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tpd52Q62393 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tpd52Q62393 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tpd52Q62393 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tpd52Q62393 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tpd52Q62393 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tpd52Q62393 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tpd52Q62393 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tpd52Q62393 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tpd52Q62393 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tpd52Q62393 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tpd52Q62393 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tpd52Q62393 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tpd52Q62393 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tpd52Q62393 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tpd52Q62393 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tpd52Q62393 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms