Protein–RNA interactions for Protein: Q62388

Atm, Serine-protein kinase ATM, mousemouse

Predictions only

Length 3,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtmQ62388 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
AtmQ62388 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AtmQ62388 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AtmQ62388 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AtmQ62388 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AtmQ62388 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AtmQ62388 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AtmQ62388 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AtmQ62388 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
AtmQ62388 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.08■□□□□ 0
AtmQ62388 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
AtmQ62388 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
AtmQ62388 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AtmQ62388 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
AtmQ62388 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AtmQ62388 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
AtmQ62388 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC15.07■□□□□ 0
AtmQ62388 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.07■□□□□ 0
AtmQ62388 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AtmQ62388 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
AtmQ62388 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AtmQ62388 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AtmQ62388 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
AtmQ62388 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AtmQ62388 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC15.07■□□□□ 0
AtmQ62388 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AtmQ62388 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AtmQ62388 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
AtmQ62388 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AtmQ62388 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.06■□□□□ 0
AtmQ62388 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AtmQ62388 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AtmQ62388 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AtmQ62388 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AtmQ62388 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AtmQ62388 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
AtmQ62388 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AtmQ62388 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AtmQ62388 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
AtmQ62388 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.06■□□□□ 0
AtmQ62388 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AtmQ62388 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AtmQ62388 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AtmQ62388 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AtmQ62388 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AtmQ62388 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AtmQ62388 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AtmQ62388 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AtmQ62388 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AtmQ62388 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
AtmQ62388 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
AtmQ62388 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AtmQ62388 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
AtmQ62388 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AtmQ62388 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AtmQ62388 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AtmQ62388 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
AtmQ62388 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
AtmQ62388 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
AtmQ62388 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
AtmQ62388 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
AtmQ62388 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
AtmQ62388 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
AtmQ62388 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.05■□□□□ 0
AtmQ62388 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
AtmQ62388 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
AtmQ62388 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
AtmQ62388 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AtmQ62388 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AtmQ62388 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
AtmQ62388 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
AtmQ62388 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AtmQ62388 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AtmQ62388 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AtmQ62388 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AtmQ62388 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AtmQ62388 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
AtmQ62388 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AtmQ62388 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AtmQ62388 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AtmQ62388 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
AtmQ62388 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AtmQ62388 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AtmQ62388 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AtmQ62388 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AtmQ62388 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AtmQ62388 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
AtmQ62388 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.04■□□□□ -0
AtmQ62388 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.04■□□□□ -0
AtmQ62388 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AtmQ62388 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AtmQ62388 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AtmQ62388 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
AtmQ62388 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AtmQ62388 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AtmQ62388 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AtmQ62388 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.04■□□□□ -0
AtmQ62388 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AtmQ62388 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AtmQ62388 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms