Protein–RNA interactions for Protein: Q62383

Supt6h, Transcription elongation factor SPT6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt6hQ62383 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Supt6hQ62383 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Supt6hQ62383 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Supt6hQ62383 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Supt6hQ62383 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Supt6hQ62383 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Supt6hQ62383 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Supt6hQ62383 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Supt6hQ62383 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Supt6hQ62383 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Supt6hQ62383 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Supt6hQ62383 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Supt6hQ62383 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Supt6hQ62383 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Supt6hQ62383 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Supt6hQ62383 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Supt6hQ62383 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Supt6hQ62383 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Supt6hQ62383 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Supt6hQ62383 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Supt6hQ62383 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Supt6hQ62383 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Supt6hQ62383 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Supt6hQ62383 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Supt6hQ62383 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Supt6hQ62383 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Supt6hQ62383 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Supt6hQ62383 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Supt6hQ62383 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Supt6hQ62383 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Supt6hQ62383 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Supt6hQ62383 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Supt6hQ62383 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Supt6hQ62383 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Supt6hQ62383 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Supt6hQ62383 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Supt6hQ62383 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Supt6hQ62383 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Supt6hQ62383 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Supt6hQ62383 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Supt6hQ62383 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Supt6hQ62383 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Supt6hQ62383 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Supt6hQ62383 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Supt6hQ62383 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Supt6hQ62383 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Supt6hQ62383 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Supt6hQ62383 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Supt6hQ62383 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Supt6hQ62383 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Supt6hQ62383 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Supt6hQ62383 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Supt6hQ62383 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Supt6hQ62383 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Supt6hQ62383 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Supt6hQ62383 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Supt6hQ62383 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Supt6hQ62383 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Supt6hQ62383 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Supt6hQ62383 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Supt6hQ62383 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Supt6hQ62383 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Supt6hQ62383 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Supt6hQ62383 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Supt6hQ62383 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Supt6hQ62383 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Supt6hQ62383 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Supt6hQ62383 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Supt6hQ62383 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Supt6hQ62383 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Supt6hQ62383 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Supt6hQ62383 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Supt6hQ62383 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Supt6hQ62383 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Supt6hQ62383 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Supt6hQ62383 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Supt6hQ62383 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Supt6hQ62383 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Supt6hQ62383 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Supt6hQ62383 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Supt6hQ62383 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Supt6hQ62383 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Supt6hQ62383 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Supt6hQ62383 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Supt6hQ62383 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Supt6hQ62383 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Supt6hQ62383 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Supt6hQ62383 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Supt6hQ62383 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Supt6hQ62383 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Supt6hQ62383 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Supt6hQ62383 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Supt6hQ62383 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Supt6hQ62383 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Supt6hQ62383 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Supt6hQ62383 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Supt6hQ62383 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Supt6hQ62383 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Supt6hQ62383 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Supt6hQ62383 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms