Protein–RNA interactions for Protein: Q62280

Ss18, Protein SSXT, mousemouse

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18Q62280 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ss18Q62280 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ss18Q62280 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ss18Q62280 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ss18Q62280 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ss18Q62280 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ss18Q62280 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ss18Q62280 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ss18Q62280 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ss18Q62280 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ss18Q62280 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ss18Q62280 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ss18Q62280 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ss18Q62280 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ss18Q62280 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ss18Q62280 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ss18Q62280 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ss18Q62280 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Ss18Q62280 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ss18Q62280 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ss18Q62280 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ss18Q62280 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ss18Q62280 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Ss18Q62280 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ss18Q62280 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ss18Q62280 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ss18Q62280 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ss18Q62280 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ss18Q62280 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ss18Q62280 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ss18Q62280 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ss18Q62280 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ss18Q62280 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ss18Q62280 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ss18Q62280 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Ss18Q62280 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ss18Q62280 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Ss18Q62280 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ss18Q62280 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ss18Q62280 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Ss18Q62280 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Ss18Q62280 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Ss18Q62280 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ss18Q62280 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ss18Q62280 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ss18Q62280 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ss18Q62280 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Ss18Q62280 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ss18Q62280 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ss18Q62280 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ss18Q62280 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ss18Q62280 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ss18Q62280 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ss18Q62280 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ss18Q62280 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ss18Q62280 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ss18Q62280 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Ss18Q62280 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
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