Protein–RNA interactions for Protein: Q62234

Myom1, Myomesin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myom1Q62234 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Myom1Q62234 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Myom1Q62234 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Myom1Q62234 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Myom1Q62234 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Myom1Q62234 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Myom1Q62234 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Myom1Q62234 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Myom1Q62234 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Myom1Q62234 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Myom1Q62234 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Myom1Q62234 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Myom1Q62234 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Myom1Q62234 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Myom1Q62234 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Myom1Q62234 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Myom1Q62234 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Myom1Q62234 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Myom1Q62234 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Myom1Q62234 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Myom1Q62234 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Myom1Q62234 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Myom1Q62234 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Myom1Q62234 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Myom1Q62234 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Myom1Q62234 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Myom1Q62234 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Myom1Q62234 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Myom1Q62234 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Myom1Q62234 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Myom1Q62234 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Myom1Q62234 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Myom1Q62234 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Myom1Q62234 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Myom1Q62234 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Myom1Q62234 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Myom1Q62234 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Myom1Q62234 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Myom1Q62234 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Myom1Q62234 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Myom1Q62234 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Myom1Q62234 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Myom1Q62234 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Myom1Q62234 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Myom1Q62234 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Myom1Q62234 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Myom1Q62234 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Myom1Q62234 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Myom1Q62234 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Myom1Q62234 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Myom1Q62234 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Myom1Q62234 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Myom1Q62234 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Myom1Q62234 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Myom1Q62234 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Myom1Q62234 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Myom1Q62234 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Myom1Q62234 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Myom1Q62234 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Myom1Q62234 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Myom1Q62234 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Myom1Q62234 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Myom1Q62234 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Myom1Q62234 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Myom1Q62234 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Myom1Q62234 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Myom1Q62234 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Myom1Q62234 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Myom1Q62234 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Myom1Q62234 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Myom1Q62234 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Myom1Q62234 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Myom1Q62234 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Myom1Q62234 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Myom1Q62234 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Myom1Q62234 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Myom1Q62234 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Myom1Q62234 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Myom1Q62234 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Myom1Q62234 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Myom1Q62234 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Myom1Q62234 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Myom1Q62234 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Myom1Q62234 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Myom1Q62234 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Myom1Q62234 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Myom1Q62234 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Myom1Q62234 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Myom1Q62234 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Myom1Q62234 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Myom1Q62234 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Myom1Q62234 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Myom1Q62234 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Myom1Q62234 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Myom1Q62234 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Myom1Q62234 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Myom1Q62234 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Myom1Q62234 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Myom1Q62234 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Myom1Q62234 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms