Protein–RNA interactions for Protein: Q61990

Pcbp2, Poly(rC)-binding protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcbp2Q61990 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pcbp2Q61990 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pcbp2Q61990 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Pcbp2Q61990 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pcbp2Q61990 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pcbp2Q61990 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pcbp2Q61990 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pcbp2Q61990 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pcbp2Q61990 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pcbp2Q61990 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pcbp2Q61990 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pcbp2Q61990 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pcbp2Q61990 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pcbp2Q61990 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pcbp2Q61990 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pcbp2Q61990 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pcbp2Q61990 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pcbp2Q61990 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pcbp2Q61990 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Pcbp2Q61990 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pcbp2Q61990 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pcbp2Q61990 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pcbp2Q61990 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Pcbp2Q61990 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pcbp2Q61990 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pcbp2Q61990 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pcbp2Q61990 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pcbp2Q61990 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pcbp2Q61990 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pcbp2Q61990 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pcbp2Q61990 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pcbp2Q61990 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pcbp2Q61990 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pcbp2Q61990 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pcbp2Q61990 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pcbp2Q61990 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pcbp2Q61990 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pcbp2Q61990 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pcbp2Q61990 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pcbp2Q61990 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pcbp2Q61990 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pcbp2Q61990 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pcbp2Q61990 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pcbp2Q61990 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Pcbp2Q61990 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pcbp2Q61990 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pcbp2Q61990 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pcbp2Q61990 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pcbp2Q61990 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pcbp2Q61990 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pcbp2Q61990 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pcbp2Q61990 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pcbp2Q61990 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pcbp2Q61990 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pcbp2Q61990 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pcbp2Q61990 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pcbp2Q61990 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pcbp2Q61990 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pcbp2Q61990 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pcbp2Q61990 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pcbp2Q61990 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pcbp2Q61990 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pcbp2Q61990 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pcbp2Q61990 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pcbp2Q61990 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pcbp2Q61990 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pcbp2Q61990 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pcbp2Q61990 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pcbp2Q61990 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pcbp2Q61990 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pcbp2Q61990 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pcbp2Q61990 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pcbp2Q61990 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pcbp2Q61990 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pcbp2Q61990 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pcbp2Q61990 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pcbp2Q61990 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pcbp2Q61990 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pcbp2Q61990 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Pcbp2Q61990 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pcbp2Q61990 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pcbp2Q61990 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pcbp2Q61990 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pcbp2Q61990 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Pcbp2Q61990 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pcbp2Q61990 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pcbp2Q61990 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pcbp2Q61990 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pcbp2Q61990 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pcbp2Q61990 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pcbp2Q61990 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pcbp2Q61990 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pcbp2Q61990 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Pcbp2Q61990 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pcbp2Q61990 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pcbp2Q61990 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pcbp2Q61990 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pcbp2Q61990 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pcbp2Q61990 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pcbp2Q61990 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms