Protein–RNA interactions for Protein: Q61602

Gli3, Transcriptional activator GLI3, mousemouse

Predictions only

Length 1,583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli3Q61602 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gli3Q61602 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gli3Q61602 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gli3Q61602 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gli3Q61602 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gli3Q61602 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gli3Q61602 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gli3Q61602 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Gli3Q61602 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gli3Q61602 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Gli3Q61602 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gli3Q61602 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gli3Q61602 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gli3Q61602 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gli3Q61602 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gli3Q61602 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gli3Q61602 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gli3Q61602 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gli3Q61602 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gli3Q61602 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gli3Q61602 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gli3Q61602 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gli3Q61602 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gli3Q61602 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gli3Q61602 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gli3Q61602 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gli3Q61602 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gli3Q61602 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gli3Q61602 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gli3Q61602 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gli3Q61602 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gli3Q61602 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gli3Q61602 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gli3Q61602 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gli3Q61602 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gli3Q61602 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gli3Q61602 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gli3Q61602 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gli3Q61602 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gli3Q61602 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Gli3Q61602 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gli3Q61602 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gli3Q61602 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gli3Q61602 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gli3Q61602 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gli3Q61602 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gli3Q61602 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gli3Q61602 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gli3Q61602 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gli3Q61602 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gli3Q61602 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gli3Q61602 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gli3Q61602 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gli3Q61602 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gli3Q61602 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gli3Q61602 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gli3Q61602 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gli3Q61602 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Gli3Q61602 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gli3Q61602 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gli3Q61602 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gli3Q61602 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gli3Q61602 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gli3Q61602 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gli3Q61602 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gli3Q61602 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gli3Q61602 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gli3Q61602 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gli3Q61602 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gli3Q61602 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gli3Q61602 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gli3Q61602 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gli3Q61602 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gli3Q61602 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Gli3Q61602 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Gli3Q61602 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Gli3Q61602 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gli3Q61602 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gli3Q61602 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gli3Q61602 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gli3Q61602 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gli3Q61602 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gli3Q61602 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gli3Q61602 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gli3Q61602 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gli3Q61602 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gli3Q61602 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Gli3Q61602 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Gli3Q61602 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gli3Q61602 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gli3Q61602 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gli3Q61602 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gli3Q61602 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gli3Q61602 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gli3Q61602 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gli3Q61602 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Gli3Q61602 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gli3Q61602 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gli3Q61602 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Gli3Q61602 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms