Protein–RNA interactions for Protein: Q61165

Slc9a1, Sodium/hydrogen exchanger 1, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9a1Q61165 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc9a1Q61165 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc9a1Q61165 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc9a1Q61165 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc9a1Q61165 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc9a1Q61165 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc9a1Q61165 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc9a1Q61165 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc9a1Q61165 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc9a1Q61165 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc9a1Q61165 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc9a1Q61165 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc9a1Q61165 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc9a1Q61165 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc9a1Q61165 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc9a1Q61165 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc9a1Q61165 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc9a1Q61165 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc9a1Q61165 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc9a1Q61165 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc9a1Q61165 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc9a1Q61165 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc9a1Q61165 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc9a1Q61165 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc9a1Q61165 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc9a1Q61165 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc9a1Q61165 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc9a1Q61165 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc9a1Q61165 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc9a1Q61165 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc9a1Q61165 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc9a1Q61165 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc9a1Q61165 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc9a1Q61165 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc9a1Q61165 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc9a1Q61165 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc9a1Q61165 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc9a1Q61165 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc9a1Q61165 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc9a1Q61165 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc9a1Q61165 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc9a1Q61165 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc9a1Q61165 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc9a1Q61165 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc9a1Q61165 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc9a1Q61165 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc9a1Q61165 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc9a1Q61165 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc9a1Q61165 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc9a1Q61165 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc9a1Q61165 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc9a1Q61165 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc9a1Q61165 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc9a1Q61165 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc9a1Q61165 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc9a1Q61165 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc9a1Q61165 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc9a1Q61165 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc9a1Q61165 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc9a1Q61165 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc9a1Q61165 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc9a1Q61165 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc9a1Q61165 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc9a1Q61165 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc9a1Q61165 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc9a1Q61165 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc9a1Q61165 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc9a1Q61165 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc9a1Q61165 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc9a1Q61165 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc9a1Q61165 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc9a1Q61165 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc9a1Q61165 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc9a1Q61165 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc9a1Q61165 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc9a1Q61165 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Slc9a1Q61165 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Slc9a1Q61165 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Slc9a1Q61165 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Slc9a1Q61165 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Slc9a1Q61165 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Slc9a1Q61165 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Slc9a1Q61165 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Slc9a1Q61165 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc9a1Q61165 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc9a1Q61165 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc9a1Q61165 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc9a1Q61165 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc9a1Q61165 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc9a1Q61165 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc9a1Q61165 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc9a1Q61165 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc9a1Q61165 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc9a1Q61165 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc9a1Q61165 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc9a1Q61165 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc9a1Q61165 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc9a1Q61165 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc9a1Q61165 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Slc9a1Q61165 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms