Protein–RNA interactions for Protein: Q61045

Sim1, Single-minded homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sim1Q61045 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sim1Q61045 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sim1Q61045 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sim1Q61045 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sim1Q61045 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sim1Q61045 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sim1Q61045 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sim1Q61045 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sim1Q61045 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sim1Q61045 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sim1Q61045 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sim1Q61045 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sim1Q61045 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sim1Q61045 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sim1Q61045 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sim1Q61045 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sim1Q61045 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sim1Q61045 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sim1Q61045 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sim1Q61045 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sim1Q61045 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sim1Q61045 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sim1Q61045 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sim1Q61045 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sim1Q61045 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sim1Q61045 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sim1Q61045 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sim1Q61045 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sim1Q61045 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sim1Q61045 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sim1Q61045 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sim1Q61045 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sim1Q61045 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sim1Q61045 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sim1Q61045 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sim1Q61045 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sim1Q61045 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sim1Q61045 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sim1Q61045 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Sim1Q61045 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sim1Q61045 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sim1Q61045 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sim1Q61045 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sim1Q61045 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sim1Q61045 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sim1Q61045 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sim1Q61045 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sim1Q61045 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sim1Q61045 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sim1Q61045 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sim1Q61045 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sim1Q61045 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Sim1Q61045 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sim1Q61045 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sim1Q61045 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sim1Q61045 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sim1Q61045 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sim1Q61045 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sim1Q61045 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sim1Q61045 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sim1Q61045 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sim1Q61045 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sim1Q61045 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sim1Q61045 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sim1Q61045 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sim1Q61045 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sim1Q61045 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sim1Q61045 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sim1Q61045 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sim1Q61045 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sim1Q61045 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sim1Q61045 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sim1Q61045 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sim1Q61045 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sim1Q61045 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sim1Q61045 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sim1Q61045 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sim1Q61045 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sim1Q61045 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sim1Q61045 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sim1Q61045 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sim1Q61045 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sim1Q61045 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sim1Q61045 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sim1Q61045 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sim1Q61045 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sim1Q61045 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sim1Q61045 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sim1Q61045 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sim1Q61045 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sim1Q61045 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sim1Q61045 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sim1Q61045 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sim1Q61045 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sim1Q61045 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sim1Q61045 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sim1Q61045 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sim1Q61045 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sim1Q61045 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sim1Q61045 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms