Protein–RNA interactions for Protein: Q60973

Rbbp7, Histone-binding protein RBBP7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp7Q60973 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbbp7Q60973 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbbp7Q60973 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbbp7Q60973 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbbp7Q60973 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbbp7Q60973 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbbp7Q60973 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbbp7Q60973 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbbp7Q60973 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbbp7Q60973 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbbp7Q60973 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbbp7Q60973 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbbp7Q60973 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbbp7Q60973 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbbp7Q60973 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbbp7Q60973 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbbp7Q60973 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbbp7Q60973 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rbbp7Q60973 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbbp7Q60973 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbbp7Q60973 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbbp7Q60973 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbbp7Q60973 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbbp7Q60973 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbbp7Q60973 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbbp7Q60973 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbbp7Q60973 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbbp7Q60973 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbbp7Q60973 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbbp7Q60973 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbbp7Q60973 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbbp7Q60973 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbbp7Q60973 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbbp7Q60973 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbbp7Q60973 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbbp7Q60973 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbbp7Q60973 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbbp7Q60973 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbbp7Q60973 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbbp7Q60973 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbbp7Q60973 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbbp7Q60973 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbbp7Q60973 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbbp7Q60973 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbbp7Q60973 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbbp7Q60973 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbbp7Q60973 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbbp7Q60973 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbbp7Q60973 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbbp7Q60973 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbbp7Q60973 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbbp7Q60973 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbbp7Q60973 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbbp7Q60973 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rbbp7Q60973 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbbp7Q60973 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbbp7Q60973 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbbp7Q60973 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbbp7Q60973 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbbp7Q60973 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbbp7Q60973 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbbp7Q60973 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbbp7Q60973 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbbp7Q60973 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbbp7Q60973 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbbp7Q60973 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbbp7Q60973 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbbp7Q60973 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbbp7Q60973 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbbp7Q60973 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbbp7Q60973 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbbp7Q60973 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbbp7Q60973 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbbp7Q60973 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbbp7Q60973 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbbp7Q60973 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbbp7Q60973 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbbp7Q60973 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbbp7Q60973 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbbp7Q60973 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rbbp7Q60973 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rbbp7Q60973 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rbbp7Q60973 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rbbp7Q60973 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rbbp7Q60973 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rbbp7Q60973 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rbbp7Q60973 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rbbp7Q60973 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rbbp7Q60973 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rbbp7Q60973 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rbbp7Q60973 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rbbp7Q60973 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rbbp7Q60973 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rbbp7Q60973 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rbbp7Q60973 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rbbp7Q60973 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rbbp7Q60973 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rbbp7Q60973 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rbbp7Q60973 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rbbp7Q60973 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 305 ms