Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbbp4Q60972 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbbp4Q60972 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbbp4Q60972 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbbp4Q60972 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbbp4Q60972 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbbp4Q60972 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rbbp4Q60972 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbbp4Q60972 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbbp4Q60972 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbbp4Q60972 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbbp4Q60972 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbbp4Q60972 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbbp4Q60972 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbbp4Q60972 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbbp4Q60972 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbbp4Q60972 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbbp4Q60972 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbbp4Q60972 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbbp4Q60972 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbbp4Q60972 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbbp4Q60972 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbbp4Q60972 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbbp4Q60972 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbbp4Q60972 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbbp4Q60972 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbbp4Q60972 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbbp4Q60972 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbbp4Q60972 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbbp4Q60972 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbbp4Q60972 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbbp4Q60972 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbbp4Q60972 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rbbp4Q60972 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rbbp4Q60972 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rbbp4Q60972 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rbbp4Q60972 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rbbp4Q60972 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rbbp4Q60972 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rbbp4Q60972 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rbbp4Q60972 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rbbp4Q60972 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rbbp4Q60972 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rbbp4Q60972 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rbbp4Q60972 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Rbbp4Q60972 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rbbp4Q60972 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rbbp4Q60972 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rbbp4Q60972 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rbbp4Q60972 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rbbp4Q60972 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rbbp4Q60972 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Rbbp4Q60972 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rbbp4Q60972 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rbbp4Q60972 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rbbp4Q60972 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rbbp4Q60972 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rbbp4Q60972 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rbbp4Q60972 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbbp4Q60972 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbbp4Q60972 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbbp4Q60972 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbbp4Q60972 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbbp4Q60972 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbbp4Q60972 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbbp4Q60972 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbbp4Q60972 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Rbbp4Q60972 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rbbp4Q60972 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rbbp4Q60972 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbbp4Q60972 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbbp4Q60972 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbbp4Q60972 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbbp4Q60972 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbbp4Q60972 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbbp4Q60972 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rbbp4Q60972 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbbp4Q60972 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rbbp4Q60972 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbbp4Q60972 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbbp4Q60972 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbbp4Q60972 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbbp4Q60972 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbbp4Q60972 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbbp4Q60972 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbbp4Q60972 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbbp4Q60972 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rbbp4Q60972 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rbbp4Q60972 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rbbp4Q60972 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rbbp4Q60972 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rbbp4Q60972 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rbbp4Q60972 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rbbp4Q60972 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rbbp4Q60972 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Rbbp4Q60972 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rbbp4Q60972 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rbbp4Q60972 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rbbp4Q60972 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Rbbp4Q60972 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms