Protein–RNA interactions for Protein: Q60846

Tnfrsf8, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 8, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf8Q60846 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfrsf8Q60846 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfrsf8Q60846 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfrsf8Q60846 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfrsf8Q60846 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfrsf8Q60846 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfrsf8Q60846 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tnfrsf8Q60846 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfrsf8Q60846 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfrsf8Q60846 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfrsf8Q60846 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfrsf8Q60846 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfrsf8Q60846 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfrsf8Q60846 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfrsf8Q60846 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfrsf8Q60846 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfrsf8Q60846 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfrsf8Q60846 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfrsf8Q60846 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfrsf8Q60846 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfrsf8Q60846 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfrsf8Q60846 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfrsf8Q60846 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfrsf8Q60846 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfrsf8Q60846 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tnfrsf8Q60846 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Tnfrsf8Q60846 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tnfrsf8Q60846 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tnfrsf8Q60846 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tnfrsf8Q60846 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Tnfrsf8Q60846 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfrsf8Q60846 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfrsf8Q60846 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfrsf8Q60846 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfrsf8Q60846 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfrsf8Q60846 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfrsf8Q60846 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfrsf8Q60846 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tnfrsf8Q60846 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tnfrsf8Q60846 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfrsf8Q60846 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfrsf8Q60846 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfrsf8Q60846 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfrsf8Q60846 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfrsf8Q60846 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfrsf8Q60846 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfrsf8Q60846 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfrsf8Q60846 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfrsf8Q60846 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfrsf8Q60846 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfrsf8Q60846 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfrsf8Q60846 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfrsf8Q60846 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tnfrsf8Q60846 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfrsf8Q60846 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfrsf8Q60846 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfrsf8Q60846 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfrsf8Q60846 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfrsf8Q60846 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfrsf8Q60846 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfrsf8Q60846 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfrsf8Q60846 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfrsf8Q60846 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfrsf8Q60846 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfrsf8Q60846 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfrsf8Q60846 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfrsf8Q60846 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tnfrsf8Q60846 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfrsf8Q60846 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfrsf8Q60846 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfrsf8Q60846 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfrsf8Q60846 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tnfrsf8Q60846 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfrsf8Q60846 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfrsf8Q60846 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfrsf8Q60846 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfrsf8Q60846 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfrsf8Q60846 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfrsf8Q60846 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfrsf8Q60846 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfrsf8Q60846 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tnfrsf8Q60846 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfrsf8Q60846 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfrsf8Q60846 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfrsf8Q60846 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfrsf8Q60846 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfrsf8Q60846 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfrsf8Q60846 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfrsf8Q60846 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfrsf8Q60846 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfrsf8Q60846 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfrsf8Q60846 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfrsf8Q60846 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfrsf8Q60846 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfrsf8Q60846 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfrsf8Q60846 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Tnfrsf8Q60846 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfrsf8Q60846 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Tnfrsf8Q60846 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tnfrsf8Q60846 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms