Protein–RNA interactions for Protein: Q60772

Cdkn2c, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor C, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn2cQ60772 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdkn2cQ60772 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdkn2cQ60772 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdkn2cQ60772 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdkn2cQ60772 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdkn2cQ60772 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdkn2cQ60772 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdkn2cQ60772 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdkn2cQ60772 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdkn2cQ60772 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdkn2cQ60772 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdkn2cQ60772 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdkn2cQ60772 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdkn2cQ60772 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdkn2cQ60772 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdkn2cQ60772 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdkn2cQ60772 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdkn2cQ60772 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdkn2cQ60772 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdkn2cQ60772 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdkn2cQ60772 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdkn2cQ60772 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdkn2cQ60772 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdkn2cQ60772 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdkn2cQ60772 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdkn2cQ60772 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdkn2cQ60772 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdkn2cQ60772 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdkn2cQ60772 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdkn2cQ60772 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdkn2cQ60772 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdkn2cQ60772 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdkn2cQ60772 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdkn2cQ60772 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdkn2cQ60772 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdkn2cQ60772 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdkn2cQ60772 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdkn2cQ60772 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdkn2cQ60772 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdkn2cQ60772 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdkn2cQ60772 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdkn2cQ60772 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdkn2cQ60772 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdkn2cQ60772 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdkn2cQ60772 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdkn2cQ60772 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdkn2cQ60772 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdkn2cQ60772 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdkn2cQ60772 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdkn2cQ60772 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdkn2cQ60772 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdkn2cQ60772 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdkn2cQ60772 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdkn2cQ60772 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdkn2cQ60772 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdkn2cQ60772 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdkn2cQ60772 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdkn2cQ60772 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdkn2cQ60772 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdkn2cQ60772 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdkn2cQ60772 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdkn2cQ60772 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdkn2cQ60772 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdkn2cQ60772 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdkn2cQ60772 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdkn2cQ60772 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdkn2cQ60772 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdkn2cQ60772 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdkn2cQ60772 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdkn2cQ60772 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdkn2cQ60772 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdkn2cQ60772 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdkn2cQ60772 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdkn2cQ60772 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdkn2cQ60772 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdkn2cQ60772 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdkn2cQ60772 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdkn2cQ60772 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdkn2cQ60772 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdkn2cQ60772 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdkn2cQ60772 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdkn2cQ60772 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdkn2cQ60772 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdkn2cQ60772 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdkn2cQ60772 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdkn2cQ60772 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdkn2cQ60772 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdkn2cQ60772 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdkn2cQ60772 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdkn2cQ60772 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdkn2cQ60772 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdkn2cQ60772 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdkn2cQ60772 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdkn2cQ60772 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdkn2cQ60772 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdkn2cQ60772 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdkn2cQ60772 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdkn2cQ60772 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdkn2cQ60772 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdkn2cQ60772 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms