Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atf3Q60765 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atf3Q60765 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atf3Q60765 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atf3Q60765 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atf3Q60765 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atf3Q60765 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Atf3Q60765 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Atf3Q60765 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atf3Q60765 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atf3Q60765 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Atf3Q60765 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Atf3Q60765 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Atf3Q60765 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atf3Q60765 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atf3Q60765 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atf3Q60765 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atf3Q60765 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atf3Q60765 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atf3Q60765 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atf3Q60765 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atf3Q60765 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atf3Q60765 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atf3Q60765 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atf3Q60765 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atf3Q60765 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atf3Q60765 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Atf3Q60765 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atf3Q60765 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atf3Q60765 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atf3Q60765 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atf3Q60765 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atf3Q60765 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atf3Q60765 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atf3Q60765 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atf3Q60765 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Atf3Q60765 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atf3Q60765 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atf3Q60765 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atf3Q60765 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Atf3Q60765 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atf3Q60765 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atf3Q60765 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atf3Q60765 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atf3Q60765 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Atf3Q60765 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Atf3Q60765 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Atf3Q60765 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Atf3Q60765 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Atf3Q60765 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Atf3Q60765 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Atf3Q60765 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Atf3Q60765 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Atf3Q60765 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Atf3Q60765 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Atf3Q60765 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Atf3Q60765 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Atf3Q60765 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Atf3Q60765 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Atf3Q60765 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Atf3Q60765 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Atf3Q60765 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Atf3Q60765 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Atf3Q60765 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Atf3Q60765 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Atf3Q60765 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
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Atf3Q60765 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
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Atf3Q60765 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
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Atf3Q60765 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Atf3Q60765 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Atf3Q60765 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Atf3Q60765 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atf3Q60765 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atf3Q60765 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Atf3Q60765 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atf3Q60765 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atf3Q60765 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atf3Q60765 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atf3Q60765 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atf3Q60765 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atf3Q60765 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atf3Q60765 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atf3Q60765 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atf3Q60765 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atf3Q60765 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atf3Q60765 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atf3Q60765 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atf3Q60765 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atf3Q60765 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atf3Q60765 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atf3Q60765 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atf3Q60765 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atf3Q60765 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms