Protein–RNA interactions for Protein: Q60764

Mkrn3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn3Q60764 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Mkrn3Q60764 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mkrn3Q60764 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mkrn3Q60764 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mkrn3Q60764 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mkrn3Q60764 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mkrn3Q60764 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mkrn3Q60764 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Mkrn3Q60764 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mkrn3Q60764 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mkrn3Q60764 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mkrn3Q60764 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mkrn3Q60764 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mkrn3Q60764 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mkrn3Q60764 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mkrn3Q60764 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mkrn3Q60764 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mkrn3Q60764 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mkrn3Q60764 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mkrn3Q60764 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mkrn3Q60764 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mkrn3Q60764 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mkrn3Q60764 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mkrn3Q60764 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mkrn3Q60764 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mkrn3Q60764 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mkrn3Q60764 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mkrn3Q60764 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mkrn3Q60764 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mkrn3Q60764 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mkrn3Q60764 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mkrn3Q60764 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mkrn3Q60764 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mkrn3Q60764 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mkrn3Q60764 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mkrn3Q60764 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mkrn3Q60764 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mkrn3Q60764 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mkrn3Q60764 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mkrn3Q60764 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mkrn3Q60764 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mkrn3Q60764 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mkrn3Q60764 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mkrn3Q60764 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mkrn3Q60764 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mkrn3Q60764 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mkrn3Q60764 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mkrn3Q60764 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mkrn3Q60764 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mkrn3Q60764 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mkrn3Q60764 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mkrn3Q60764 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mkrn3Q60764 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mkrn3Q60764 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mkrn3Q60764 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mkrn3Q60764 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mkrn3Q60764 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mkrn3Q60764 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mkrn3Q60764 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mkrn3Q60764 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mkrn3Q60764 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mkrn3Q60764 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mkrn3Q60764 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Mkrn3Q60764 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mkrn3Q60764 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mkrn3Q60764 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mkrn3Q60764 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mkrn3Q60764 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mkrn3Q60764 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mkrn3Q60764 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mkrn3Q60764 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mkrn3Q60764 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mkrn3Q60764 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mkrn3Q60764 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mkrn3Q60764 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mkrn3Q60764 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mkrn3Q60764 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mkrn3Q60764 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mkrn3Q60764 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mkrn3Q60764 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mkrn3Q60764 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mkrn3Q60764 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mkrn3Q60764 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mkrn3Q60764 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mkrn3Q60764 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mkrn3Q60764 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mkrn3Q60764 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mkrn3Q60764 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Mkrn3Q60764 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mkrn3Q60764 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mkrn3Q60764 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mkrn3Q60764 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mkrn3Q60764 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mkrn3Q60764 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mkrn3Q60764 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mkrn3Q60764 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mkrn3Q60764 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mkrn3Q60764 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mkrn3Q60764 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mkrn3Q60764 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms