Protein–RNA interactions for Protein: Q60668

Hnrnpd, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein D0, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HnrnpdQ60668 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HnrnpdQ60668 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HnrnpdQ60668 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HnrnpdQ60668 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HnrnpdQ60668 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HnrnpdQ60668 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HnrnpdQ60668 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HnrnpdQ60668 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HnrnpdQ60668 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HnrnpdQ60668 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HnrnpdQ60668 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HnrnpdQ60668 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HnrnpdQ60668 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HnrnpdQ60668 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HnrnpdQ60668 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HnrnpdQ60668 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HnrnpdQ60668 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HnrnpdQ60668 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HnrnpdQ60668 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HnrnpdQ60668 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HnrnpdQ60668 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
HnrnpdQ60668 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
HnrnpdQ60668 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HnrnpdQ60668 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HnrnpdQ60668 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HnrnpdQ60668 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HnrnpdQ60668 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HnrnpdQ60668 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HnrnpdQ60668 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HnrnpdQ60668 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HnrnpdQ60668 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HnrnpdQ60668 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HnrnpdQ60668 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HnrnpdQ60668 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HnrnpdQ60668 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HnrnpdQ60668 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HnrnpdQ60668 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HnrnpdQ60668 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HnrnpdQ60668 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HnrnpdQ60668 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HnrnpdQ60668 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HnrnpdQ60668 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HnrnpdQ60668 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HnrnpdQ60668 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HnrnpdQ60668 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HnrnpdQ60668 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HnrnpdQ60668 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HnrnpdQ60668 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HnrnpdQ60668 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HnrnpdQ60668 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HnrnpdQ60668 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HnrnpdQ60668 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HnrnpdQ60668 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HnrnpdQ60668 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HnrnpdQ60668 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HnrnpdQ60668 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HnrnpdQ60668 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HnrnpdQ60668 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HnrnpdQ60668 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HnrnpdQ60668 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HnrnpdQ60668 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HnrnpdQ60668 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HnrnpdQ60668 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HnrnpdQ60668 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HnrnpdQ60668 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HnrnpdQ60668 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HnrnpdQ60668 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HnrnpdQ60668 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HnrnpdQ60668 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HnrnpdQ60668 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HnrnpdQ60668 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HnrnpdQ60668 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HnrnpdQ60668 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HnrnpdQ60668 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HnrnpdQ60668 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HnrnpdQ60668 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HnrnpdQ60668 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HnrnpdQ60668 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HnrnpdQ60668 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HnrnpdQ60668 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HnrnpdQ60668 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HnrnpdQ60668 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HnrnpdQ60668 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HnrnpdQ60668 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HnrnpdQ60668 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HnrnpdQ60668 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HnrnpdQ60668 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HnrnpdQ60668 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HnrnpdQ60668 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HnrnpdQ60668 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HnrnpdQ60668 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HnrnpdQ60668 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HnrnpdQ60668 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HnrnpdQ60668 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HnrnpdQ60668 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HnrnpdQ60668 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HnrnpdQ60668 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
HnrnpdQ60668 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HnrnpdQ60668 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HnrnpdQ60668 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms