Protein–RNA interactions for Protein: Q60649

Clpb, Caseinolytic peptidase B protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClpbQ60649 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ClpbQ60649 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ClpbQ60649 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ClpbQ60649 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ClpbQ60649 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ClpbQ60649 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ClpbQ60649 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ClpbQ60649 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ClpbQ60649 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ClpbQ60649 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ClpbQ60649 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ClpbQ60649 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ClpbQ60649 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ClpbQ60649 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ClpbQ60649 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ClpbQ60649 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ClpbQ60649 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ClpbQ60649 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ClpbQ60649 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ClpbQ60649 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ClpbQ60649 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ClpbQ60649 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ClpbQ60649 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ClpbQ60649 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ClpbQ60649 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ClpbQ60649 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ClpbQ60649 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ClpbQ60649 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ClpbQ60649 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ClpbQ60649 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ClpbQ60649 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ClpbQ60649 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ClpbQ60649 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ClpbQ60649 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ClpbQ60649 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ClpbQ60649 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ClpbQ60649 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ClpbQ60649 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ClpbQ60649 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ClpbQ60649 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ClpbQ60649 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ClpbQ60649 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ClpbQ60649 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ClpbQ60649 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ClpbQ60649 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ClpbQ60649 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ClpbQ60649 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ClpbQ60649 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ClpbQ60649 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ClpbQ60649 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ClpbQ60649 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ClpbQ60649 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ClpbQ60649 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ClpbQ60649 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ClpbQ60649 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ClpbQ60649 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ClpbQ60649 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ClpbQ60649 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ClpbQ60649 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ClpbQ60649 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ClpbQ60649 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ClpbQ60649 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ClpbQ60649 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ClpbQ60649 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ClpbQ60649 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ClpbQ60649 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ClpbQ60649 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ClpbQ60649 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ClpbQ60649 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ClpbQ60649 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ClpbQ60649 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ClpbQ60649 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ClpbQ60649 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ClpbQ60649 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ClpbQ60649 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ClpbQ60649 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ClpbQ60649 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ClpbQ60649 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ClpbQ60649 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ClpbQ60649 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ClpbQ60649 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ClpbQ60649 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ClpbQ60649 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ClpbQ60649 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ClpbQ60649 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ClpbQ60649 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ClpbQ60649 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ClpbQ60649 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ClpbQ60649 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ClpbQ60649 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ClpbQ60649 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ClpbQ60649 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ClpbQ60649 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ClpbQ60649 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ClpbQ60649 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ClpbQ60649 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ClpbQ60649 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ClpbQ60649 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ClpbQ60649 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ClpbQ60649 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms