Protein–RNA interactions for Protein: Q60636

Prdm1, PR domain zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm1Q60636 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prdm1Q60636 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prdm1Q60636 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prdm1Q60636 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prdm1Q60636 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prdm1Q60636 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prdm1Q60636 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prdm1Q60636 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prdm1Q60636 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prdm1Q60636 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prdm1Q60636 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prdm1Q60636 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prdm1Q60636 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prdm1Q60636 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prdm1Q60636 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prdm1Q60636 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prdm1Q60636 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prdm1Q60636 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prdm1Q60636 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prdm1Q60636 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prdm1Q60636 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prdm1Q60636 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prdm1Q60636 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prdm1Q60636 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prdm1Q60636 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prdm1Q60636 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prdm1Q60636 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prdm1Q60636 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prdm1Q60636 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prdm1Q60636 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Prdm1Q60636 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prdm1Q60636 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prdm1Q60636 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prdm1Q60636 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prdm1Q60636 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prdm1Q60636 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prdm1Q60636 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prdm1Q60636 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prdm1Q60636 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prdm1Q60636 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prdm1Q60636 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prdm1Q60636 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prdm1Q60636 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prdm1Q60636 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prdm1Q60636 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Prdm1Q60636 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Prdm1Q60636 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Prdm1Q60636 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prdm1Q60636 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prdm1Q60636 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prdm1Q60636 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prdm1Q60636 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prdm1Q60636 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prdm1Q60636 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prdm1Q60636 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prdm1Q60636 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prdm1Q60636 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prdm1Q60636 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prdm1Q60636 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prdm1Q60636 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prdm1Q60636 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prdm1Q60636 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prdm1Q60636 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prdm1Q60636 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prdm1Q60636 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prdm1Q60636 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prdm1Q60636 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prdm1Q60636 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prdm1Q60636 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prdm1Q60636 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prdm1Q60636 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prdm1Q60636 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prdm1Q60636 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prdm1Q60636 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prdm1Q60636 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prdm1Q60636 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prdm1Q60636 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prdm1Q60636 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prdm1Q60636 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prdm1Q60636 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prdm1Q60636 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prdm1Q60636 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prdm1Q60636 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prdm1Q60636 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prdm1Q60636 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prdm1Q60636 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prdm1Q60636 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prdm1Q60636 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prdm1Q60636 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prdm1Q60636 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Prdm1Q60636 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prdm1Q60636 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Prdm1Q60636 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Prdm1Q60636 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prdm1Q60636 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prdm1Q60636 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prdm1Q60636 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prdm1Q60636 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prdm1Q60636 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prdm1Q60636 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms