Protein–RNA interactions for Protein: Q60598

Cttn, Src substrate cortactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CttnQ60598 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CttnQ60598 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CttnQ60598 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CttnQ60598 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CttnQ60598 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CttnQ60598 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CttnQ60598 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CttnQ60598 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CttnQ60598 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CttnQ60598 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CttnQ60598 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CttnQ60598 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CttnQ60598 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CttnQ60598 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CttnQ60598 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CttnQ60598 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CttnQ60598 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CttnQ60598 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CttnQ60598 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CttnQ60598 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CttnQ60598 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CttnQ60598 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CttnQ60598 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CttnQ60598 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CttnQ60598 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CttnQ60598 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CttnQ60598 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CttnQ60598 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CttnQ60598 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CttnQ60598 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CttnQ60598 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CttnQ60598 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CttnQ60598 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CttnQ60598 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CttnQ60598 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CttnQ60598 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CttnQ60598 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CttnQ60598 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CttnQ60598 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CttnQ60598 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CttnQ60598 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CttnQ60598 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CttnQ60598 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CttnQ60598 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CttnQ60598 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CttnQ60598 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CttnQ60598 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CttnQ60598 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CttnQ60598 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
CttnQ60598 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
CttnQ60598 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CttnQ60598 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CttnQ60598 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CttnQ60598 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
CttnQ60598 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CttnQ60598 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CttnQ60598 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CttnQ60598 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CttnQ60598 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CttnQ60598 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CttnQ60598 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CttnQ60598 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CttnQ60598 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CttnQ60598 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CttnQ60598 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CttnQ60598 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CttnQ60598 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CttnQ60598 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CttnQ60598 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CttnQ60598 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CttnQ60598 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CttnQ60598 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CttnQ60598 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CttnQ60598 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CttnQ60598 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CttnQ60598 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CttnQ60598 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CttnQ60598 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CttnQ60598 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CttnQ60598 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CttnQ60598 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CttnQ60598 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CttnQ60598 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CttnQ60598 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CttnQ60598 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CttnQ60598 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CttnQ60598 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CttnQ60598 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CttnQ60598 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CttnQ60598 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CttnQ60598 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CttnQ60598 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CttnQ60598 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CttnQ60598 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CttnQ60598 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CttnQ60598 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CttnQ60598 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CttnQ60598 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CttnQ60598 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CttnQ60598 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms