Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sin3aQ60520 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sin3aQ60520 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sin3aQ60520 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sin3aQ60520 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sin3aQ60520 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sin3aQ60520 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sin3aQ60520 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sin3aQ60520 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sin3aQ60520 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sin3aQ60520 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sin3aQ60520 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sin3aQ60520 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sin3aQ60520 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sin3aQ60520 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sin3aQ60520 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sin3aQ60520 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sin3aQ60520 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sin3aQ60520 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sin3aQ60520 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sin3aQ60520 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sin3aQ60520 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sin3aQ60520 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sin3aQ60520 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sin3aQ60520 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sin3aQ60520 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sin3aQ60520 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Sin3aQ60520 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sin3aQ60520 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sin3aQ60520 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sin3aQ60520 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sin3aQ60520 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sin3aQ60520 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sin3aQ60520 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sin3aQ60520 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sin3aQ60520 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sin3aQ60520 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sin3aQ60520 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sin3aQ60520 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Sin3aQ60520 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sin3aQ60520 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sin3aQ60520 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sin3aQ60520 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sin3aQ60520 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sin3aQ60520 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sin3aQ60520 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sin3aQ60520 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sin3aQ60520 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sin3aQ60520 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sin3aQ60520 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sin3aQ60520 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sin3aQ60520 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sin3aQ60520 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sin3aQ60520 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sin3aQ60520 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sin3aQ60520 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sin3aQ60520 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Sin3aQ60520 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sin3aQ60520 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sin3aQ60520 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Sin3aQ60520 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sin3aQ60520 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sin3aQ60520 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Sin3aQ60520 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Sin3aQ60520 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sin3aQ60520 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sin3aQ60520 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sin3aQ60520 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sin3aQ60520 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sin3aQ60520 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Sin3aQ60520 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sin3aQ60520 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sin3aQ60520 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sin3aQ60520 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sin3aQ60520 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Sin3aQ60520 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sin3aQ60520 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sin3aQ60520 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sin3aQ60520 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Sin3aQ60520 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sin3aQ60520 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sin3aQ60520 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sin3aQ60520 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sin3aQ60520 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sin3aQ60520 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Sin3aQ60520 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sin3aQ60520 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sin3aQ60520 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sin3aQ60520 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sin3aQ60520 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sin3aQ60520 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sin3aQ60520 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sin3aQ60520 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sin3aQ60520 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sin3aQ60520 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sin3aQ60520 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sin3aQ60520 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sin3aQ60520 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sin3aQ60520 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sin3aQ60520 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms