Protein–RNA interactions for Protein: Q5XF89

Atp13a3, Probable cation-transporting ATPase 13A3, mousemouse

Predictions only

Length 1,219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a3Q5XF89 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp13a3Q5XF89 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp13a3Q5XF89 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp13a3Q5XF89 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atp13a3Q5XF89 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Atp13a3Q5XF89 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Atp13a3Q5XF89 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Atp13a3Q5XF89 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Atp13a3Q5XF89 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Atp13a3Q5XF89 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atp13a3Q5XF89 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Atp13a3Q5XF89 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atp13a3Q5XF89 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atp13a3Q5XF89 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atp13a3Q5XF89 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atp13a3Q5XF89 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atp13a3Q5XF89 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atp13a3Q5XF89 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atp13a3Q5XF89 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atp13a3Q5XF89 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atp13a3Q5XF89 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atp13a3Q5XF89 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atp13a3Q5XF89 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atp13a3Q5XF89 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atp13a3Q5XF89 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atp13a3Q5XF89 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atp13a3Q5XF89 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atp13a3Q5XF89 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp13a3Q5XF89 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp13a3Q5XF89 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp13a3Q5XF89 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp13a3Q5XF89 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp13a3Q5XF89 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp13a3Q5XF89 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp13a3Q5XF89 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp13a3Q5XF89 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp13a3Q5XF89 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp13a3Q5XF89 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp13a3Q5XF89 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp13a3Q5XF89 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp13a3Q5XF89 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp13a3Q5XF89 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp13a3Q5XF89 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp13a3Q5XF89 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp13a3Q5XF89 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp13a3Q5XF89 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp13a3Q5XF89 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp13a3Q5XF89 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp13a3Q5XF89 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp13a3Q5XF89 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp13a3Q5XF89 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp13a3Q5XF89 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp13a3Q5XF89 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp13a3Q5XF89 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp13a3Q5XF89 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atp13a3Q5XF89 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp13a3Q5XF89 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp13a3Q5XF89 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp13a3Q5XF89 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp13a3Q5XF89 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp13a3Q5XF89 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp13a3Q5XF89 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp13a3Q5XF89 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp13a3Q5XF89 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp13a3Q5XF89 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp13a3Q5XF89 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp13a3Q5XF89 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp13a3Q5XF89 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp13a3Q5XF89 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp13a3Q5XF89 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp13a3Q5XF89 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp13a3Q5XF89 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp13a3Q5XF89 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp13a3Q5XF89 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atp13a3Q5XF89 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp13a3Q5XF89 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp13a3Q5XF89 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp13a3Q5XF89 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp13a3Q5XF89 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp13a3Q5XF89 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp13a3Q5XF89 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp13a3Q5XF89 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp13a3Q5XF89 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp13a3Q5XF89 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp13a3Q5XF89 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp13a3Q5XF89 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp13a3Q5XF89 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp13a3Q5XF89 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp13a3Q5XF89 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp13a3Q5XF89 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp13a3Q5XF89 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp13a3Q5XF89 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp13a3Q5XF89 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp13a3Q5XF89 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp13a3Q5XF89 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp13a3Q5XF89 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp13a3Q5XF89 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp13a3Q5XF89 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp13a3Q5XF89 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atp13a3Q5XF89 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms