Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4C1

Gprasp1, G-protein coupled receptor-associated sorting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gprasp1Q5U4C1 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gprasp1Q5U4C1 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gprasp1Q5U4C1 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Gprasp1Q5U4C1 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gprasp1Q5U4C1 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gprasp1Q5U4C1 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gprasp1Q5U4C1 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gprasp1Q5U4C1 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gprasp1Q5U4C1 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Gprasp1Q5U4C1 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gprasp1Q5U4C1 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gprasp1Q5U4C1 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gprasp1Q5U4C1 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gprasp1Q5U4C1 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gprasp1Q5U4C1 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gprasp1Q5U4C1 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Gprasp1Q5U4C1 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Gprasp1Q5U4C1 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Gprasp1Q5U4C1 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gprasp1Q5U4C1 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gprasp1Q5U4C1 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gprasp1Q5U4C1 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gprasp1Q5U4C1 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gprasp1Q5U4C1 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gprasp1Q5U4C1 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gprasp1Q5U4C1 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gprasp1Q5U4C1 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gprasp1Q5U4C1 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gprasp1Q5U4C1 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gprasp1Q5U4C1 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gprasp1Q5U4C1 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gprasp1Q5U4C1 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gprasp1Q5U4C1 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Gprasp1Q5U4C1 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gprasp1Q5U4C1 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gprasp1Q5U4C1 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gprasp1Q5U4C1 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gprasp1Q5U4C1 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gprasp1Q5U4C1 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gprasp1Q5U4C1 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gprasp1Q5U4C1 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gprasp1Q5U4C1 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Gprasp1Q5U4C1 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gprasp1Q5U4C1 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gprasp1Q5U4C1 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gprasp1Q5U4C1 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Gprasp1Q5U4C1 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gprasp1Q5U4C1 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gprasp1Q5U4C1 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gprasp1Q5U4C1 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gprasp1Q5U4C1 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gprasp1Q5U4C1 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gprasp1Q5U4C1 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gprasp1Q5U4C1 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gprasp1Q5U4C1 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gprasp1Q5U4C1 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gprasp1Q5U4C1 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gprasp1Q5U4C1 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gprasp1Q5U4C1 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Gprasp1Q5U4C1 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Gprasp1Q5U4C1 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Gprasp1Q5U4C1 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gprasp1Q5U4C1 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gprasp1Q5U4C1 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gprasp1Q5U4C1 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gprasp1Q5U4C1 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gprasp1Q5U4C1 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gprasp1Q5U4C1 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gprasp1Q5U4C1 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gprasp1Q5U4C1 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gprasp1Q5U4C1 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gprasp1Q5U4C1 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gprasp1Q5U4C1 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gprasp1Q5U4C1 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gprasp1Q5U4C1 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Gprasp1Q5U4C1 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Gprasp1Q5U4C1 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gprasp1Q5U4C1 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gprasp1Q5U4C1 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gprasp1Q5U4C1 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gprasp1Q5U4C1 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gprasp1Q5U4C1 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gprasp1Q5U4C1 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gprasp1Q5U4C1 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gprasp1Q5U4C1 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Gprasp1Q5U4C1 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gprasp1Q5U4C1 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gprasp1Q5U4C1 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Gprasp1Q5U4C1 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gprasp1Q5U4C1 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gprasp1Q5U4C1 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gprasp1Q5U4C1 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Gprasp1Q5U4C1 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gprasp1Q5U4C1 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gprasp1Q5U4C1 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gprasp1Q5U4C1 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gprasp1Q5U4C1 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gprasp1Q5U4C1 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gprasp1Q5U4C1 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gprasp1Q5U4C1 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms