Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZ99

Trim38, Tripartite motif-containing 38, mousemouse

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Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim38Q5SZ99 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim38Q5SZ99 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim38Q5SZ99 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim38Q5SZ99 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim38Q5SZ99 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim38Q5SZ99 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim38Q5SZ99 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim38Q5SZ99 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Trim38Q5SZ99 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim38Q5SZ99 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim38Q5SZ99 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim38Q5SZ99 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim38Q5SZ99 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim38Q5SZ99 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Trim38Q5SZ99 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim38Q5SZ99 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim38Q5SZ99 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim38Q5SZ99 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim38Q5SZ99 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim38Q5SZ99 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim38Q5SZ99 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim38Q5SZ99 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim38Q5SZ99 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim38Q5SZ99 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim38Q5SZ99 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Trim38Q5SZ99 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Trim38Q5SZ99 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Trim38Q5SZ99 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Trim38Q5SZ99 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trim38Q5SZ99 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Trim38Q5SZ99 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trim38Q5SZ99 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Trim38Q5SZ99 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Trim38Q5SZ99 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trim38Q5SZ99 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trim38Q5SZ99 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trim38Q5SZ99 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trim38Q5SZ99 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trim38Q5SZ99 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trim38Q5SZ99 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trim38Q5SZ99 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trim38Q5SZ99 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trim38Q5SZ99 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trim38Q5SZ99 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trim38Q5SZ99 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Trim38Q5SZ99 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trim38Q5SZ99 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trim38Q5SZ99 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trim38Q5SZ99 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trim38Q5SZ99 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trim38Q5SZ99 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trim38Q5SZ99 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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