Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVD6

Vmn1r195, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r195Q5SVD6 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vmn1r195Q5SVD6 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vmn1r195Q5SVD6 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vmn1r195Q5SVD6 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vmn1r195Q5SVD6 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vmn1r195Q5SVD6 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Vmn1r195Q5SVD6 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Vmn1r195Q5SVD6 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Vmn1r195Q5SVD6 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Vmn1r195Q5SVD6 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Vmn1r195Q5SVD6 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
Vmn1r195Q5SVD6 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Vmn1r195Q5SVD6 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Vmn1r195Q5SVD6 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Vmn1r195Q5SVD6 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Vmn1r195Q5SVD6 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Vmn1r195Q5SVD6 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Vmn1r195Q5SVD6 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Vmn1r195Q5SVD6 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Vmn1r195Q5SVD6 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Vmn1r195Q5SVD6 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Vmn1r195Q5SVD6 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms