Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSW2

Psme4, Proteasome activator complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme4Q5SSW2 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Psme4Q5SSW2 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Psme4Q5SSW2 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Psme4Q5SSW2 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Psme4Q5SSW2 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Psme4Q5SSW2 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Psme4Q5SSW2 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Psme4Q5SSW2 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Psme4Q5SSW2 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Psme4Q5SSW2 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Psme4Q5SSW2 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Psme4Q5SSW2 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Psme4Q5SSW2 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Psme4Q5SSW2 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Psme4Q5SSW2 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Psme4Q5SSW2 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Psme4Q5SSW2 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Psme4Q5SSW2 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Psme4Q5SSW2 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Psme4Q5SSW2 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Psme4Q5SSW2 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Psme4Q5SSW2 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Psme4Q5SSW2 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Psme4Q5SSW2 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Psme4Q5SSW2 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Psme4Q5SSW2 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Psme4Q5SSW2 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Psme4Q5SSW2 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Psme4Q5SSW2 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Psme4Q5SSW2 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Psme4Q5SSW2 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Psme4Q5SSW2 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Psme4Q5SSW2 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Psme4Q5SSW2 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Psme4Q5SSW2 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Psme4Q5SSW2 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Psme4Q5SSW2 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Psme4Q5SSW2 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Psme4Q5SSW2 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Psme4Q5SSW2 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Psme4Q5SSW2 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Psme4Q5SSW2 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Psme4Q5SSW2 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Psme4Q5SSW2 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Psme4Q5SSW2 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Psme4Q5SSW2 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Psme4Q5SSW2 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Psme4Q5SSW2 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Psme4Q5SSW2 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Psme4Q5SSW2 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Psme4Q5SSW2 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Psme4Q5SSW2 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Psme4Q5SSW2 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Psme4Q5SSW2 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Psme4Q5SSW2 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Psme4Q5SSW2 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Psme4Q5SSW2 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Psme4Q5SSW2 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Psme4Q5SSW2 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Psme4Q5SSW2 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Psme4Q5SSW2 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Psme4Q5SSW2 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Psme4Q5SSW2 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Psme4Q5SSW2 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Psme4Q5SSW2 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Psme4Q5SSW2 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Psme4Q5SSW2 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Psme4Q5SSW2 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Psme4Q5SSW2 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Psme4Q5SSW2 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Psme4Q5SSW2 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Psme4Q5SSW2 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Psme4Q5SSW2 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Psme4Q5SSW2 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Psme4Q5SSW2 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Psme4Q5SSW2 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Psme4Q5SSW2 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Psme4Q5SSW2 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Psme4Q5SSW2 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Psme4Q5SSW2 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Psme4Q5SSW2 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Psme4Q5SSW2 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Psme4Q5SSW2 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Psme4Q5SSW2 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Psme4Q5SSW2 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Psme4Q5SSW2 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Psme4Q5SSW2 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Psme4Q5SSW2 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Psme4Q5SSW2 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Psme4Q5SSW2 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Psme4Q5SSW2 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Psme4Q5SSW2 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Psme4Q5SSW2 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Psme4Q5SSW2 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Psme4Q5SSW2 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Psme4Q5SSW2 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Psme4Q5SSW2 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Psme4Q5SSW2 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Psme4Q5SSW2 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Psme4Q5SSW2 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms