Protein–RNA interactions for Protein: Q5SNZ0

Ccdc88a, Girdin, mousemouse

Predictions only

Length 1,873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88aQ5SNZ0 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc88aQ5SNZ0 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc88aQ5SNZ0 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc88aQ5SNZ0 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc88aQ5SNZ0 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc88aQ5SNZ0 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc88aQ5SNZ0 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc88aQ5SNZ0 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc88aQ5SNZ0 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc88aQ5SNZ0 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc88aQ5SNZ0 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc88aQ5SNZ0 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc88aQ5SNZ0 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc88aQ5SNZ0 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc88aQ5SNZ0 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc88aQ5SNZ0 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc88aQ5SNZ0 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc88aQ5SNZ0 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc88aQ5SNZ0 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc88aQ5SNZ0 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc88aQ5SNZ0 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc88aQ5SNZ0 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc88aQ5SNZ0 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc88aQ5SNZ0 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc88aQ5SNZ0 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc88aQ5SNZ0 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc88aQ5SNZ0 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc88aQ5SNZ0 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc88aQ5SNZ0 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc88aQ5SNZ0 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc88aQ5SNZ0 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc88aQ5SNZ0 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc88aQ5SNZ0 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc88aQ5SNZ0 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc88aQ5SNZ0 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc88aQ5SNZ0 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc88aQ5SNZ0 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc88aQ5SNZ0 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc88aQ5SNZ0 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc88aQ5SNZ0 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc88aQ5SNZ0 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc88aQ5SNZ0 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc88aQ5SNZ0 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc88aQ5SNZ0 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc88aQ5SNZ0 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc88aQ5SNZ0 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc88aQ5SNZ0 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc88aQ5SNZ0 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc88aQ5SNZ0 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc88aQ5SNZ0 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc88aQ5SNZ0 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc88aQ5SNZ0 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc88aQ5SNZ0 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc88aQ5SNZ0 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc88aQ5SNZ0 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc88aQ5SNZ0 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc88aQ5SNZ0 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc88aQ5SNZ0 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc88aQ5SNZ0 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc88aQ5SNZ0 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc88aQ5SNZ0 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc88aQ5SNZ0 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc88aQ5SNZ0 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc88aQ5SNZ0 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc88aQ5SNZ0 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc88aQ5SNZ0 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc88aQ5SNZ0 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc88aQ5SNZ0 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc88aQ5SNZ0 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc88aQ5SNZ0 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc88aQ5SNZ0 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc88aQ5SNZ0 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc88aQ5SNZ0 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc88aQ5SNZ0 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc88aQ5SNZ0 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc88aQ5SNZ0 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc88aQ5SNZ0 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc88aQ5SNZ0 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc88aQ5SNZ0 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc88aQ5SNZ0 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc88aQ5SNZ0 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc88aQ5SNZ0 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc88aQ5SNZ0 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc88aQ5SNZ0 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc88aQ5SNZ0 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc88aQ5SNZ0 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms