Protein–RNA interactions for Protein: Q5RKV8

Pfpl, Pfpl protein, mousemouse

Predictions only

Length 702 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PfplQ5RKV8 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PfplQ5RKV8 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PfplQ5RKV8 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PfplQ5RKV8 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PfplQ5RKV8 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PfplQ5RKV8 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PfplQ5RKV8 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PfplQ5RKV8 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PfplQ5RKV8 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PfplQ5RKV8 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PfplQ5RKV8 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PfplQ5RKV8 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PfplQ5RKV8 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PfplQ5RKV8 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PfplQ5RKV8 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PfplQ5RKV8 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PfplQ5RKV8 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PfplQ5RKV8 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PfplQ5RKV8 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PfplQ5RKV8 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PfplQ5RKV8 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PfplQ5RKV8 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PfplQ5RKV8 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PfplQ5RKV8 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PfplQ5RKV8 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PfplQ5RKV8 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PfplQ5RKV8 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PfplQ5RKV8 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PfplQ5RKV8 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PfplQ5RKV8 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PfplQ5RKV8 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PfplQ5RKV8 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PfplQ5RKV8 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PfplQ5RKV8 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PfplQ5RKV8 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PfplQ5RKV8 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PfplQ5RKV8 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PfplQ5RKV8 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PfplQ5RKV8 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PfplQ5RKV8 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PfplQ5RKV8 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PfplQ5RKV8 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PfplQ5RKV8 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PfplQ5RKV8 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PfplQ5RKV8 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PfplQ5RKV8 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PfplQ5RKV8 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PfplQ5RKV8 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PfplQ5RKV8 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PfplQ5RKV8 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PfplQ5RKV8 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PfplQ5RKV8 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PfplQ5RKV8 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PfplQ5RKV8 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PfplQ5RKV8 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PfplQ5RKV8 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PfplQ5RKV8 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PfplQ5RKV8 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PfplQ5RKV8 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PfplQ5RKV8 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PfplQ5RKV8 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PfplQ5RKV8 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PfplQ5RKV8 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PfplQ5RKV8 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PfplQ5RKV8 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PfplQ5RKV8 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PfplQ5RKV8 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PfplQ5RKV8 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PfplQ5RKV8 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PfplQ5RKV8 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PfplQ5RKV8 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PfplQ5RKV8 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PfplQ5RKV8 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PfplQ5RKV8 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PfplQ5RKV8 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PfplQ5RKV8 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PfplQ5RKV8 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PfplQ5RKV8 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PfplQ5RKV8 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PfplQ5RKV8 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PfplQ5RKV8 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PfplQ5RKV8 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PfplQ5RKV8 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PfplQ5RKV8 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PfplQ5RKV8 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PfplQ5RKV8 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PfplQ5RKV8 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PfplQ5RKV8 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PfplQ5RKV8 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PfplQ5RKV8 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PfplQ5RKV8 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PfplQ5RKV8 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PfplQ5RKV8 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PfplQ5RKV8 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PfplQ5RKV8 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PfplQ5RKV8 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PfplQ5RKV8 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PfplQ5RKV8 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PfplQ5RKV8 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PfplQ5RKV8 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms