Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJI4

Pkdcc, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PkdccQ5RJI4 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PkdccQ5RJI4 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PkdccQ5RJI4 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PkdccQ5RJI4 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PkdccQ5RJI4 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PkdccQ5RJI4 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PkdccQ5RJI4 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PkdccQ5RJI4 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PkdccQ5RJI4 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PkdccQ5RJI4 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PkdccQ5RJI4 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PkdccQ5RJI4 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PkdccQ5RJI4 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PkdccQ5RJI4 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PkdccQ5RJI4 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PkdccQ5RJI4 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PkdccQ5RJI4 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PkdccQ5RJI4 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PkdccQ5RJI4 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PkdccQ5RJI4 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PkdccQ5RJI4 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PkdccQ5RJI4 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PkdccQ5RJI4 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PkdccQ5RJI4 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PkdccQ5RJI4 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PkdccQ5RJI4 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PkdccQ5RJI4 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PkdccQ5RJI4 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PkdccQ5RJI4 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PkdccQ5RJI4 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PkdccQ5RJI4 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PkdccQ5RJI4 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PkdccQ5RJI4 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PkdccQ5RJI4 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PkdccQ5RJI4 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PkdccQ5RJI4 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PkdccQ5RJI4 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PkdccQ5RJI4 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PkdccQ5RJI4 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PkdccQ5RJI4 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PkdccQ5RJI4 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PkdccQ5RJI4 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PkdccQ5RJI4 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PkdccQ5RJI4 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PkdccQ5RJI4 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PkdccQ5RJI4 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PkdccQ5RJI4 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PkdccQ5RJI4 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PkdccQ5RJI4 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PkdccQ5RJI4 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PkdccQ5RJI4 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PkdccQ5RJI4 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PkdccQ5RJI4 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PkdccQ5RJI4 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PkdccQ5RJI4 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PkdccQ5RJI4 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PkdccQ5RJI4 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PkdccQ5RJI4 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PkdccQ5RJI4 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PkdccQ5RJI4 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PkdccQ5RJI4 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PkdccQ5RJI4 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PkdccQ5RJI4 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PkdccQ5RJI4 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PkdccQ5RJI4 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PkdccQ5RJI4 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PkdccQ5RJI4 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PkdccQ5RJI4 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PkdccQ5RJI4 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PkdccQ5RJI4 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PkdccQ5RJI4 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PkdccQ5RJI4 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PkdccQ5RJI4 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PkdccQ5RJI4 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PkdccQ5RJI4 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PkdccQ5RJI4 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PkdccQ5RJI4 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PkdccQ5RJI4 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PkdccQ5RJI4 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PkdccQ5RJI4 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PkdccQ5RJI4 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PkdccQ5RJI4 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PkdccQ5RJI4 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PkdccQ5RJI4 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PkdccQ5RJI4 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PkdccQ5RJI4 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PkdccQ5RJI4 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PkdccQ5RJI4 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PkdccQ5RJI4 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PkdccQ5RJI4 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PkdccQ5RJI4 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PkdccQ5RJI4 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PkdccQ5RJI4 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PkdccQ5RJI4 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PkdccQ5RJI4 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PkdccQ5RJI4 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PkdccQ5RJI4 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PkdccQ5RJI4 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PkdccQ5RJI4 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PkdccQ5RJI4 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms