Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJB0

Bhlha9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlha9Q5RJB0 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Bhlha9Q5RJB0 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bhlha9Q5RJB0 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Bhlha9Q5RJB0 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bhlha9Q5RJB0 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Bhlha9Q5RJB0 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bhlha9Q5RJB0 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bhlha9Q5RJB0 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bhlha9Q5RJB0 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bhlha9Q5RJB0 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bhlha9Q5RJB0 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bhlha9Q5RJB0 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bhlha9Q5RJB0 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bhlha9Q5RJB0 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bhlha9Q5RJB0 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Bhlha9Q5RJB0 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Bhlha9Q5RJB0 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Bhlha9Q5RJB0 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Bhlha9Q5RJB0 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Bhlha9Q5RJB0 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bhlha9Q5RJB0 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Bhlha9Q5RJB0 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bhlha9Q5RJB0 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bhlha9Q5RJB0 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bhlha9Q5RJB0 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bhlha9Q5RJB0 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bhlha9Q5RJB0 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Bhlha9Q5RJB0 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bhlha9Q5RJB0 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bhlha9Q5RJB0 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bhlha9Q5RJB0 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Bhlha9Q5RJB0 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bhlha9Q5RJB0 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bhlha9Q5RJB0 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bhlha9Q5RJB0 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bhlha9Q5RJB0 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bhlha9Q5RJB0 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bhlha9Q5RJB0 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Bhlha9Q5RJB0 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Bhlha9Q5RJB0 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bhlha9Q5RJB0 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bhlha9Q5RJB0 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bhlha9Q5RJB0 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Bhlha9Q5RJB0 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bhlha9Q5RJB0 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bhlha9Q5RJB0 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Bhlha9Q5RJB0 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bhlha9Q5RJB0 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bhlha9Q5RJB0 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bhlha9Q5RJB0 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bhlha9Q5RJB0 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bhlha9Q5RJB0 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bhlha9Q5RJB0 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Bhlha9Q5RJB0 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Bhlha9Q5RJB0 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bhlha9Q5RJB0 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Bhlha9Q5RJB0 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bhlha9Q5RJB0 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bhlha9Q5RJB0 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Bhlha9Q5RJB0 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bhlha9Q5RJB0 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Bhlha9Q5RJB0 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bhlha9Q5RJB0 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bhlha9Q5RJB0 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bhlha9Q5RJB0 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bhlha9Q5RJB0 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bhlha9Q5RJB0 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bhlha9Q5RJB0 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Bhlha9Q5RJB0 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bhlha9Q5RJB0 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Bhlha9Q5RJB0 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Bhlha9Q5RJB0 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bhlha9Q5RJB0 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bhlha9Q5RJB0 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bhlha9Q5RJB0 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bhlha9Q5RJB0 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bhlha9Q5RJB0 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bhlha9Q5RJB0 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bhlha9Q5RJB0 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Bhlha9Q5RJB0 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bhlha9Q5RJB0 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bhlha9Q5RJB0 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bhlha9Q5RJB0 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bhlha9Q5RJB0 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bhlha9Q5RJB0 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bhlha9Q5RJB0 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bhlha9Q5RJB0 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Bhlha9Q5RJB0 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Bhlha9Q5RJB0 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Bhlha9Q5RJB0 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Bhlha9Q5RJB0 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Bhlha9Q5RJB0 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Bhlha9Q5RJB0 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Bhlha9Q5RJB0 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Bhlha9Q5RJB0 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Bhlha9Q5RJB0 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Bhlha9Q5RJB0 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Bhlha9Q5RJB0 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Bhlha9Q5RJB0 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Bhlha9Q5RJB0 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms