Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC9

Trim58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, mousemouse

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Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim58Q5NCC9 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Trim58Q5NCC9 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Trim58Q5NCC9 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Trim58Q5NCC9 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Trim58Q5NCC9 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Trim58Q5NCC9 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trim58Q5NCC9 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trim58Q5NCC9 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trim58Q5NCC9 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trim58Q5NCC9 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Trim58Q5NCC9 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trim58Q5NCC9 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trim58Q5NCC9 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trim58Q5NCC9 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trim58Q5NCC9 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trim58Q5NCC9 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trim58Q5NCC9 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trim58Q5NCC9 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trim58Q5NCC9 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trim58Q5NCC9 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trim58Q5NCC9 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trim58Q5NCC9 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trim58Q5NCC9 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trim58Q5NCC9 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trim58Q5NCC9 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trim58Q5NCC9 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trim58Q5NCC9 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trim58Q5NCC9 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trim58Q5NCC9 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trim58Q5NCC9 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Trim58Q5NCC9 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Trim58Q5NCC9 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trim58Q5NCC9 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trim58Q5NCC9 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trim58Q5NCC9 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trim58Q5NCC9 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trim58Q5NCC9 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trim58Q5NCC9 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trim58Q5NCC9 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trim58Q5NCC9 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trim58Q5NCC9 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trim58Q5NCC9 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trim58Q5NCC9 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trim58Q5NCC9 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trim58Q5NCC9 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trim58Q5NCC9 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trim58Q5NCC9 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trim58Q5NCC9 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Trim58Q5NCC9 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trim58Q5NCC9 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trim58Q5NCC9 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trim58Q5NCC9 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trim58Q5NCC9 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trim58Q5NCC9 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trim58Q5NCC9 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trim58Q5NCC9 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trim58Q5NCC9 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trim58Q5NCC9 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trim58Q5NCC9 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trim58Q5NCC9 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trim58Q5NCC9 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trim58Q5NCC9 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trim58Q5NCC9 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trim58Q5NCC9 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trim58Q5NCC9 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trim58Q5NCC9 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trim58Q5NCC9 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trim58Q5NCC9 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trim58Q5NCC9 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trim58Q5NCC9 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trim58Q5NCC9 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trim58Q5NCC9 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trim58Q5NCC9 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trim58Q5NCC9 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trim58Q5NCC9 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trim58Q5NCC9 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trim58Q5NCC9 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trim58Q5NCC9 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trim58Q5NCC9 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trim58Q5NCC9 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trim58Q5NCC9 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trim58Q5NCC9 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trim58Q5NCC9 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trim58Q5NCC9 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trim58Q5NCC9 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Trim58Q5NCC9 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Trim58Q5NCC9 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trim58Q5NCC9 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trim58Q5NCC9 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trim58Q5NCC9 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trim58Q5NCC9 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trim58Q5NCC9 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trim58Q5NCC9 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trim58Q5NCC9 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trim58Q5NCC9 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trim58Q5NCC9 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trim58Q5NCC9 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trim58Q5NCC9 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trim58Q5NCC9 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trim58Q5NCC9 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms