Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC3

Trim41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim41Q5NCC3 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Trim41Q5NCC3 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Trim41Q5NCC3 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Trim41Q5NCC3 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Trim41Q5NCC3 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Trim41Q5NCC3 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Trim41Q5NCC3 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Trim41Q5NCC3 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Trim41Q5NCC3 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Trim41Q5NCC3 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Trim41Q5NCC3 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Trim41Q5NCC3 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Trim41Q5NCC3 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Trim41Q5NCC3 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Trim41Q5NCC3 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Trim41Q5NCC3 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Trim41Q5NCC3 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Trim41Q5NCC3 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Trim41Q5NCC3 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Trim41Q5NCC3 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Trim41Q5NCC3 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Trim41Q5NCC3 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Trim41Q5NCC3 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Trim41Q5NCC3 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Trim41Q5NCC3 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Trim41Q5NCC3 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Trim41Q5NCC3 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Trim41Q5NCC3 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Trim41Q5NCC3 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Trim41Q5NCC3 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Trim41Q5NCC3 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Trim41Q5NCC3 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Trim41Q5NCC3 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Trim41Q5NCC3 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Trim41Q5NCC3 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Trim41Q5NCC3 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Trim41Q5NCC3 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Trim41Q5NCC3 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Trim41Q5NCC3 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Trim41Q5NCC3 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Trim41Q5NCC3 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Trim41Q5NCC3 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Trim41Q5NCC3 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Trim41Q5NCC3 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Trim41Q5NCC3 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Trim41Q5NCC3 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Trim41Q5NCC3 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Trim41Q5NCC3 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Trim41Q5NCC3 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Trim41Q5NCC3 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Trim41Q5NCC3 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Trim41Q5NCC3 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Trim41Q5NCC3 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Trim41Q5NCC3 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Trim41Q5NCC3 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Trim41Q5NCC3 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Trim41Q5NCC3 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Trim41Q5NCC3 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Trim41Q5NCC3 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Trim41Q5NCC3 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Trim41Q5NCC3 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Trim41Q5NCC3 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Trim41Q5NCC3 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Trim41Q5NCC3 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Trim41Q5NCC3 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Trim41Q5NCC3 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Trim41Q5NCC3 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Trim41Q5NCC3 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Trim41Q5NCC3 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Trim41Q5NCC3 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Trim41Q5NCC3 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Trim41Q5NCC3 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Trim41Q5NCC3 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Trim41Q5NCC3 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Trim41Q5NCC3 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Trim41Q5NCC3 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Trim41Q5NCC3 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Trim41Q5NCC3 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Trim41Q5NCC3 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Trim41Q5NCC3 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Trim41Q5NCC3 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Trim41Q5NCC3 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Trim41Q5NCC3 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Trim41Q5NCC3 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Trim41Q5NCC3 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Trim41Q5NCC3 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Trim41Q5NCC3 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Trim41Q5NCC3 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Trim41Q5NCC3 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Trim41Q5NCC3 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Trim41Q5NCC3 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Trim41Q5NCC3 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Trim41Q5NCC3 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Trim41Q5NCC3 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Trim41Q5NCC3 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Trim41Q5NCC3 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Trim41Q5NCC3 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Trim41Q5NCC3 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Trim41Q5NCC3 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Trim41Q5NCC3 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms