Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC48

Gm12253, Predicted gene 12253, mousemouse

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Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm12253Q5NC48 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gm12253Q5NC48 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gm12253Q5NC48 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gm12253Q5NC48 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm12253Q5NC48 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm12253Q5NC48 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm12253Q5NC48 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm12253Q5NC48 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm12253Q5NC48 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm12253Q5NC48 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm12253Q5NC48 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm12253Q5NC48 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm12253Q5NC48 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm12253Q5NC48 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm12253Q5NC48 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm12253Q5NC48 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm12253Q5NC48 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm12253Q5NC48 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm12253Q5NC48 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm12253Q5NC48 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm12253Q5NC48 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm12253Q5NC48 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm12253Q5NC48 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm12253Q5NC48 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm12253Q5NC48 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm12253Q5NC48 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm12253Q5NC48 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm12253Q5NC48 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm12253Q5NC48 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm12253Q5NC48 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm12253Q5NC48 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm12253Q5NC48 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm12253Q5NC48 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm12253Q5NC48 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm12253Q5NC48 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm12253Q5NC48 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm12253Q5NC48 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm12253Q5NC48 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm12253Q5NC48 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm12253Q5NC48 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm12253Q5NC48 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Gm12253Q5NC48 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm12253Q5NC48 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm12253Q5NC48 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm12253Q5NC48 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm12253Q5NC48 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm12253Q5NC48 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm12253Q5NC48 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm12253Q5NC48 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm12253Q5NC48 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm12253Q5NC48 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm12253Q5NC48 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm12253Q5NC48 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Gm12253Q5NC48 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gm12253Q5NC48 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Gm12253Q5NC48 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Gm12253Q5NC48 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm12253Q5NC48 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm12253Q5NC48 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm12253Q5NC48 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm12253Q5NC48 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm12253Q5NC48 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm12253Q5NC48 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm12253Q5NC48 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm12253Q5NC48 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm12253Q5NC48 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm12253Q5NC48 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm12253Q5NC48 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm12253Q5NC48 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm12253Q5NC48 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm12253Q5NC48 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm12253Q5NC48 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm12253Q5NC48 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm12253Q5NC48 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm12253Q5NC48 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm12253Q5NC48 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm12253Q5NC48 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm12253Q5NC48 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm12253Q5NC48 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm12253Q5NC48 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm12253Q5NC48 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm12253Q5NC48 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm12253Q5NC48 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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