Protein–RNA interactions for Protein: Q58FA4

E2f8, Transcription factor E2F8, mousemouse

Predictions only

Length 860 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f8Q58FA4 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
E2f8Q58FA4 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
E2f8Q58FA4 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
E2f8Q58FA4 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
E2f8Q58FA4 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
E2f8Q58FA4 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
E2f8Q58FA4 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
E2f8Q58FA4 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
E2f8Q58FA4 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
E2f8Q58FA4 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2f8Q58FA4 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2f8Q58FA4 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2f8Q58FA4 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2f8Q58FA4 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2f8Q58FA4 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2f8Q58FA4 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2f8Q58FA4 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2f8Q58FA4 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2f8Q58FA4 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2f8Q58FA4 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2f8Q58FA4 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2f8Q58FA4 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2f8Q58FA4 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2f8Q58FA4 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2f8Q58FA4 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2f8Q58FA4 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2f8Q58FA4 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2f8Q58FA4 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2f8Q58FA4 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2f8Q58FA4 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2f8Q58FA4 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2f8Q58FA4 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2f8Q58FA4 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2f8Q58FA4 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2f8Q58FA4 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2f8Q58FA4 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
E2f8Q58FA4 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
E2f8Q58FA4 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
E2f8Q58FA4 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
E2f8Q58FA4 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
E2f8Q58FA4 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
E2f8Q58FA4 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
E2f8Q58FA4 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
E2f8Q58FA4 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
E2f8Q58FA4 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
E2f8Q58FA4 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
E2f8Q58FA4 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
E2f8Q58FA4 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
E2f8Q58FA4 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
E2f8Q58FA4 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
E2f8Q58FA4 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
E2f8Q58FA4 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
E2f8Q58FA4 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
E2f8Q58FA4 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
E2f8Q58FA4 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
E2f8Q58FA4 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
E2f8Q58FA4 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
E2f8Q58FA4 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
E2f8Q58FA4 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
E2f8Q58FA4 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
E2f8Q58FA4 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
E2f8Q58FA4 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
E2f8Q58FA4 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
E2f8Q58FA4 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
E2f8Q58FA4 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
E2f8Q58FA4 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
E2f8Q58FA4 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2f8Q58FA4 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2f8Q58FA4 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2f8Q58FA4 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2f8Q58FA4 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2f8Q58FA4 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2f8Q58FA4 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2f8Q58FA4 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2f8Q58FA4 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2f8Q58FA4 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2f8Q58FA4 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2f8Q58FA4 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2f8Q58FA4 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2f8Q58FA4 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2f8Q58FA4 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2f8Q58FA4 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2f8Q58FA4 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2f8Q58FA4 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2f8Q58FA4 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2f8Q58FA4 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2f8Q58FA4 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
E2f8Q58FA4 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2f8Q58FA4 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
E2f8Q58FA4 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
E2f8Q58FA4 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
E2f8Q58FA4 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
E2f8Q58FA4 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
E2f8Q58FA4 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
E2f8Q58FA4 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
E2f8Q58FA4 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
E2f8Q58FA4 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
E2f8Q58FA4 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
E2f8Q58FA4 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
E2f8Q58FA4 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms