Protein–RNA interactions for Protein: Q52KR2

Lrig2, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig2Q52KR2 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrig2Q52KR2 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrig2Q52KR2 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrig2Q52KR2 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrig2Q52KR2 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrig2Q52KR2 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrig2Q52KR2 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrig2Q52KR2 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrig2Q52KR2 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrig2Q52KR2 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrig2Q52KR2 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrig2Q52KR2 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrig2Q52KR2 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrig2Q52KR2 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrig2Q52KR2 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrig2Q52KR2 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrig2Q52KR2 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrig2Q52KR2 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrig2Q52KR2 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrig2Q52KR2 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrig2Q52KR2 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrig2Q52KR2 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrig2Q52KR2 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrig2Q52KR2 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrig2Q52KR2 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrig2Q52KR2 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrig2Q52KR2 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrig2Q52KR2 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrig2Q52KR2 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrig2Q52KR2 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrig2Q52KR2 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrig2Q52KR2 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrig2Q52KR2 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrig2Q52KR2 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrig2Q52KR2 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrig2Q52KR2 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrig2Q52KR2 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrig2Q52KR2 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrig2Q52KR2 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrig2Q52KR2 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrig2Q52KR2 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrig2Q52KR2 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrig2Q52KR2 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrig2Q52KR2 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrig2Q52KR2 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrig2Q52KR2 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrig2Q52KR2 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrig2Q52KR2 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrig2Q52KR2 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrig2Q52KR2 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrig2Q52KR2 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrig2Q52KR2 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrig2Q52KR2 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrig2Q52KR2 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrig2Q52KR2 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrig2Q52KR2 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrig2Q52KR2 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrig2Q52KR2 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrig2Q52KR2 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrig2Q52KR2 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrig2Q52KR2 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrig2Q52KR2 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrig2Q52KR2 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrig2Q52KR2 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrig2Q52KR2 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrig2Q52KR2 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrig2Q52KR2 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrig2Q52KR2 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrig2Q52KR2 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrig2Q52KR2 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrig2Q52KR2 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrig2Q52KR2 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrig2Q52KR2 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrig2Q52KR2 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrig2Q52KR2 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrig2Q52KR2 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrig2Q52KR2 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrig2Q52KR2 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrig2Q52KR2 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrig2Q52KR2 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrig2Q52KR2 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrig2Q52KR2 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrig2Q52KR2 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrig2Q52KR2 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrig2Q52KR2 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrig2Q52KR2 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrig2Q52KR2 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrig2Q52KR2 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrig2Q52KR2 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrig2Q52KR2 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrig2Q52KR2 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrig2Q52KR2 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrig2Q52KR2 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrig2Q52KR2 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrig2Q52KR2 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrig2Q52KR2 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrig2Q52KR2 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrig2Q52KR2 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrig2Q52KR2 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrig2Q52KR2 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms