Protein–RNA interactions for Protein: Q52KF3

Spire1, Protein spire homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spire1Q52KF3 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spire1Q52KF3 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spire1Q52KF3 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spire1Q52KF3 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spire1Q52KF3 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spire1Q52KF3 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spire1Q52KF3 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spire1Q52KF3 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spire1Q52KF3 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spire1Q52KF3 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spire1Q52KF3 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spire1Q52KF3 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spire1Q52KF3 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spire1Q52KF3 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spire1Q52KF3 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spire1Q52KF3 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spire1Q52KF3 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spire1Q52KF3 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spire1Q52KF3 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spire1Q52KF3 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spire1Q52KF3 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spire1Q52KF3 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spire1Q52KF3 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spire1Q52KF3 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spire1Q52KF3 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Spire1Q52KF3 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Spire1Q52KF3 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Spire1Q52KF3 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Spire1Q52KF3 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Spire1Q52KF3 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Spire1Q52KF3 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Spire1Q52KF3 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Spire1Q52KF3 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Spire1Q52KF3 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Spire1Q52KF3 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Spire1Q52KF3 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Spire1Q52KF3 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Spire1Q52KF3 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Spire1Q52KF3 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Spire1Q52KF3 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Spire1Q52KF3 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Spire1Q52KF3 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Spire1Q52KF3 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Spire1Q52KF3 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Spire1Q52KF3 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Spire1Q52KF3 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Spire1Q52KF3 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Spire1Q52KF3 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Spire1Q52KF3 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Spire1Q52KF3 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Spire1Q52KF3 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Spire1Q52KF3 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spire1Q52KF3 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spire1Q52KF3 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spire1Q52KF3 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spire1Q52KF3 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spire1Q52KF3 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spire1Q52KF3 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spire1Q52KF3 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spire1Q52KF3 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Spire1Q52KF3 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spire1Q52KF3 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spire1Q52KF3 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spire1Q52KF3 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spire1Q52KF3 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spire1Q52KF3 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spire1Q52KF3 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spire1Q52KF3 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Spire1Q52KF3 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Spire1Q52KF3 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spire1Q52KF3 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spire1Q52KF3 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spire1Q52KF3 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spire1Q52KF3 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spire1Q52KF3 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spire1Q52KF3 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spire1Q52KF3 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spire1Q52KF3 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spire1Q52KF3 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spire1Q52KF3 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spire1Q52KF3 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spire1Q52KF3 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spire1Q52KF3 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spire1Q52KF3 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spire1Q52KF3 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spire1Q52KF3 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spire1Q52KF3 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spire1Q52KF3 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Spire1Q52KF3 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Spire1Q52KF3 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spire1Q52KF3 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spire1Q52KF3 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spire1Q52KF3 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spire1Q52KF3 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spire1Q52KF3 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spire1Q52KF3 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Spire1Q52KF3 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spire1Q52KF3 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spire1Q52KF3 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spire1Q52KF3 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms