Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0E1

Uncharacterized protein C9orf131 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3V0E1 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q3V0E1 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q3V0E1 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q3V0E1 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q3V0E1 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q3V0E1 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q3V0E1 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q3V0E1 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q3V0E1 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q3V0E1 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q3V0E1 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q3V0E1 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Q3V0E1 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q3V0E1 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q3V0E1 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q3V0E1 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q3V0E1 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q3V0E1 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q3V0E1 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q3V0E1 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q3V0E1 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q3V0E1 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q3V0E1 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q3V0E1 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q3V0E1 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q3V0E1 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q3V0E1 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q3V0E1 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q3V0E1 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q3V0E1 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q3V0E1 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q3V0E1 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q3V0E1 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q3V0E1 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q3V0E1 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q3V0E1 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q3V0E1 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q3V0E1 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q3V0E1 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q3V0E1 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q3V0E1 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q3V0E1 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q3V0E1 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q3V0E1 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q3V0E1 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q3V0E1 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q3V0E1 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q3V0E1 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q3V0E1 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q3V0E1 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q3V0E1 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q3V0E1 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q3V0E1 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q3V0E1 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q3V0E1 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q3V0E1 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q3V0E1 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q3V0E1 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q3V0E1 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q3V0E1 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q3V0E1 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q3V0E1 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Q3V0E1 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q3V0E1 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Q3V0E1 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q3V0E1 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q3V0E1 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q3V0E1 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q3V0E1 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q3V0E1 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q3V0E1 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q3V0E1 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q3V0E1 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q3V0E1 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q3V0E1 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q3V0E1 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q3V0E1 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q3V0E1 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q3V0E1 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q3V0E1 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q3V0E1 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q3V0E1 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q3V0E1 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q3V0E1 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q3V0E1 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q3V0E1 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q3V0E1 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q3V0E1 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q3V0E1 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Q3V0E1 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Q3V0E1 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Q3V0E1 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q3V0E1 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Q3V0E1 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q3V0E1 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q3V0E1 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q3V0E1 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q3V0E1 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q3V0E1 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Q3V0E1 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms