Protein–RNA interactions for Protein: Q3UUV9

H2-Eb2, Histocompatibility 2, class II antigen E beta2, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb2Q3UUV9 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-Eb2Q3UUV9 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-Eb2Q3UUV9 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-Eb2Q3UUV9 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-Eb2Q3UUV9 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2-Eb2Q3UUV9 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-Eb2Q3UUV9 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-Eb2Q3UUV9 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-Eb2Q3UUV9 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-Eb2Q3UUV9 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-Eb2Q3UUV9 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-Eb2Q3UUV9 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-Eb2Q3UUV9 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-Eb2Q3UUV9 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-Eb2Q3UUV9 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-Eb2Q3UUV9 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-Eb2Q3UUV9 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-Eb2Q3UUV9 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-Eb2Q3UUV9 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-Eb2Q3UUV9 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-Eb2Q3UUV9 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2-Eb2Q3UUV9 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-Eb2Q3UUV9 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-Eb2Q3UUV9 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-Eb2Q3UUV9 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-Eb2Q3UUV9 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-Eb2Q3UUV9 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-Eb2Q3UUV9 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-Eb2Q3UUV9 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-Eb2Q3UUV9 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-Eb2Q3UUV9 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-Eb2Q3UUV9 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-Eb2Q3UUV9 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-Eb2Q3UUV9 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-Eb2Q3UUV9 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-Eb2Q3UUV9 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-Eb2Q3UUV9 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-Eb2Q3UUV9 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-Eb2Q3UUV9 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-Eb2Q3UUV9 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-Eb2Q3UUV9 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-Eb2Q3UUV9 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-Eb2Q3UUV9 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-Eb2Q3UUV9 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-Eb2Q3UUV9 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-Eb2Q3UUV9 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-Eb2Q3UUV9 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-Eb2Q3UUV9 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
H2-Eb2Q3UUV9 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-Eb2Q3UUV9 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-Eb2Q3UUV9 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-Eb2Q3UUV9 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-Eb2Q3UUV9 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-Eb2Q3UUV9 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-Eb2Q3UUV9 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-Eb2Q3UUV9 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-Eb2Q3UUV9 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-Eb2Q3UUV9 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-Eb2Q3UUV9 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-Eb2Q3UUV9 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-Eb2Q3UUV9 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-Eb2Q3UUV9 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-Eb2Q3UUV9 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-Eb2Q3UUV9 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-Eb2Q3UUV9 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-Eb2Q3UUV9 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-Eb2Q3UUV9 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-Eb2Q3UUV9 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-Eb2Q3UUV9 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-Eb2Q3UUV9 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-Eb2Q3UUV9 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-Eb2Q3UUV9 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-Eb2Q3UUV9 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-Eb2Q3UUV9 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-Eb2Q3UUV9 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
H2-Eb2Q3UUV9 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-Eb2Q3UUV9 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-Eb2Q3UUV9 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-Eb2Q3UUV9 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-Eb2Q3UUV9 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-Eb2Q3UUV9 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-Eb2Q3UUV9 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-Eb2Q3UUV9 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-Eb2Q3UUV9 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-Eb2Q3UUV9 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-Eb2Q3UUV9 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-Eb2Q3UUV9 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-Eb2Q3UUV9 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-Eb2Q3UUV9 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-Eb2Q3UUV9 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-Eb2Q3UUV9 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-Eb2Q3UUV9 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-Eb2Q3UUV9 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-Eb2Q3UUV9 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-Eb2Q3UUV9 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-Eb2Q3UUV9 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-Eb2Q3UUV9 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-Eb2Q3UUV9 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-Eb2Q3UUV9 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
H2-Eb2Q3UUV9 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms