Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Znf48Q3US17 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Znf48Q3US17 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Znf48Q3US17 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Znf48Q3US17 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Znf48Q3US17 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Znf48Q3US17 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Znf48Q3US17 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Znf48Q3US17 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Znf48Q3US17 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Znf48Q3US17 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Znf48Q3US17 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Znf48Q3US17 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Znf48Q3US17 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Znf48Q3US17 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Znf48Q3US17 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Znf48Q3US17 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Znf48Q3US17 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Znf48Q3US17 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Znf48Q3US17 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Znf48Q3US17 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Znf48Q3US17 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Znf48Q3US17 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Znf48Q3US17 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Znf48Q3US17 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Znf48Q3US17 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Znf48Q3US17 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Znf48Q3US17 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Znf48Q3US17 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Znf48Q3US17 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Znf48Q3US17 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Znf48Q3US17 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Znf48Q3US17 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Znf48Q3US17 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Znf48Q3US17 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Znf48Q3US17 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Znf48Q3US17 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Znf48Q3US17 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Znf48Q3US17 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Znf48Q3US17 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Znf48Q3US17 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Znf48Q3US17 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Znf48Q3US17 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Znf48Q3US17 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Znf48Q3US17 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Znf48Q3US17 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Znf48Q3US17 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Znf48Q3US17 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Znf48Q3US17 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Znf48Q3US17 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Znf48Q3US17 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Znf48Q3US17 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Znf48Q3US17 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Znf48Q3US17 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Znf48Q3US17 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Znf48Q3US17 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Znf48Q3US17 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Znf48Q3US17 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Znf48Q3US17 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Znf48Q3US17 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Znf48Q3US17 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Znf48Q3US17 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Znf48Q3US17 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Znf48Q3US17 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Znf48Q3US17 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Znf48Q3US17 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Znf48Q3US17 4930433J02Rik-201ENSMUST00000194719 1386 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Znf48Q3US17 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Znf48Q3US17 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Znf48Q3US17 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Znf48Q3US17 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Znf48Q3US17 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Znf48Q3US17 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Znf48Q3US17 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Znf48Q3US17 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Znf48Q3US17 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Znf48Q3US17 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Znf48Q3US17 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Znf48Q3US17 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Znf48Q3US17 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Znf48Q3US17 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Znf48Q3US17 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Znf48Q3US17 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Znf48Q3US17 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Znf48Q3US17 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Znf48Q3US17 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Znf48Q3US17 4931428L18Rik-202ENSMUST00000135245 889 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Znf48Q3US17 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Znf48Q3US17 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Znf48Q3US17 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Znf48Q3US17 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Znf48Q3US17 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Znf48Q3US17 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Znf48Q3US17 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Znf48Q3US17 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Znf48Q3US17 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Znf48Q3US17 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Znf48Q3US17 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Znf48Q3US17 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Znf48Q3US17 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms