Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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D13Ertd608eQ3UPR8 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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D13Ertd608eQ3UPR8 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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D13Ertd608eQ3UPR8 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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D13Ertd608eQ3UPR8 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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D13Ertd608eQ3UPR8 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
D13Ertd608eQ3UPR8 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms