Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPH7

Arhgef40, Rho guanine nucleotide exchange factor 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgef40Q3UPH7 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Arhgef40Q3UPH7 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Arhgef40Q3UPH7 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Arhgef40Q3UPH7 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Arhgef40Q3UPH7 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Arhgef40Q3UPH7 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Arhgef40Q3UPH7 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Arhgef40Q3UPH7 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Arhgef40Q3UPH7 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Arhgef40Q3UPH7 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Arhgef40Q3UPH7 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Arhgef40Q3UPH7 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Arhgef40Q3UPH7 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Arhgef40Q3UPH7 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Arhgef40Q3UPH7 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Arhgef40Q3UPH7 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Arhgef40Q3UPH7 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Arhgef40Q3UPH7 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Arhgef40Q3UPH7 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Arhgef40Q3UPH7 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Arhgef40Q3UPH7 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Arhgef40Q3UPH7 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Arhgef40Q3UPH7 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Arhgef40Q3UPH7 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Arhgef40Q3UPH7 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Arhgef40Q3UPH7 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Arhgef40Q3UPH7 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Arhgef40Q3UPH7 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Arhgef40Q3UPH7 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Arhgef40Q3UPH7 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Arhgef40Q3UPH7 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Arhgef40Q3UPH7 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Arhgef40Q3UPH7 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Arhgef40Q3UPH7 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Arhgef40Q3UPH7 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Arhgef40Q3UPH7 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Arhgef40Q3UPH7 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Arhgef40Q3UPH7 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Arhgef40Q3UPH7 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Arhgef40Q3UPH7 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Arhgef40Q3UPH7 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Arhgef40Q3UPH7 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Arhgef40Q3UPH7 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Arhgef40Q3UPH7 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Arhgef40Q3UPH7 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Arhgef40Q3UPH7 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Arhgef40Q3UPH7 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Arhgef40Q3UPH7 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Arhgef40Q3UPH7 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Arhgef40Q3UPH7 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Arhgef40Q3UPH7 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Arhgef40Q3UPH7 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Arhgef40Q3UPH7 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Arhgef40Q3UPH7 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Arhgef40Q3UPH7 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Arhgef40Q3UPH7 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Arhgef40Q3UPH7 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Arhgef40Q3UPH7 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Arhgef40Q3UPH7 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Arhgef40Q3UPH7 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Arhgef40Q3UPH7 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Arhgef40Q3UPH7 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Arhgef40Q3UPH7 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Arhgef40Q3UPH7 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Arhgef40Q3UPH7 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Arhgef40Q3UPH7 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Arhgef40Q3UPH7 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Arhgef40Q3UPH7 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Arhgef40Q3UPH7 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Arhgef40Q3UPH7 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Arhgef40Q3UPH7 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Arhgef40Q3UPH7 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Arhgef40Q3UPH7 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Arhgef40Q3UPH7 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Arhgef40Q3UPH7 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Arhgef40Q3UPH7 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Arhgef40Q3UPH7 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Arhgef40Q3UPH7 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Arhgef40Q3UPH7 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Arhgef40Q3UPH7 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Arhgef40Q3UPH7 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Arhgef40Q3UPH7 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Arhgef40Q3UPH7 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Arhgef40Q3UPH7 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Arhgef40Q3UPH7 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Arhgef40Q3UPH7 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Arhgef40Q3UPH7 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Arhgef40Q3UPH7 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Arhgef40Q3UPH7 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Arhgef40Q3UPH7 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Arhgef40Q3UPH7 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Arhgef40Q3UPH7 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Arhgef40Q3UPH7 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Arhgef40Q3UPH7 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Arhgef40Q3UPH7 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Arhgef40Q3UPH7 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Arhgef40Q3UPH7 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Arhgef40Q3UPH7 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Arhgef40Q3UPH7 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Arhgef40Q3UPH7 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
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