Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW6

Ccdc33, Coiled-coil domain-containing protein 33, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc33Q3ULW6 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc33Q3ULW6 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ccdc33Q3ULW6 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ccdc33Q3ULW6 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ccdc33Q3ULW6 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ccdc33Q3ULW6 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ccdc33Q3ULW6 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ccdc33Q3ULW6 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc33Q3ULW6 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc33Q3ULW6 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc33Q3ULW6 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc33Q3ULW6 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc33Q3ULW6 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc33Q3ULW6 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc33Q3ULW6 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc33Q3ULW6 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc33Q3ULW6 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc33Q3ULW6 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc33Q3ULW6 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc33Q3ULW6 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc33Q3ULW6 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc33Q3ULW6 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc33Q3ULW6 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc33Q3ULW6 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc33Q3ULW6 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc33Q3ULW6 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc33Q3ULW6 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc33Q3ULW6 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc33Q3ULW6 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc33Q3ULW6 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc33Q3ULW6 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc33Q3ULW6 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc33Q3ULW6 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc33Q3ULW6 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc33Q3ULW6 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc33Q3ULW6 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc33Q3ULW6 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc33Q3ULW6 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc33Q3ULW6 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc33Q3ULW6 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc33Q3ULW6 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc33Q3ULW6 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc33Q3ULW6 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc33Q3ULW6 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc33Q3ULW6 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc33Q3ULW6 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc33Q3ULW6 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc33Q3ULW6 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc33Q3ULW6 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc33Q3ULW6 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc33Q3ULW6 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc33Q3ULW6 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc33Q3ULW6 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc33Q3ULW6 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc33Q3ULW6 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc33Q3ULW6 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc33Q3ULW6 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc33Q3ULW6 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc33Q3ULW6 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc33Q3ULW6 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc33Q3ULW6 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc33Q3ULW6 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc33Q3ULW6 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc33Q3ULW6 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc33Q3ULW6 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc33Q3ULW6 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc33Q3ULW6 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc33Q3ULW6 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc33Q3ULW6 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc33Q3ULW6 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc33Q3ULW6 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc33Q3ULW6 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc33Q3ULW6 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc33Q3ULW6 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc33Q3ULW6 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc33Q3ULW6 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc33Q3ULW6 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc33Q3ULW6 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc33Q3ULW6 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc33Q3ULW6 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc33Q3ULW6 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc33Q3ULW6 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc33Q3ULW6 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc33Q3ULW6 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc33Q3ULW6 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc33Q3ULW6 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc33Q3ULW6 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc33Q3ULW6 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc33Q3ULW6 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc33Q3ULW6 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc33Q3ULW6 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc33Q3ULW6 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc33Q3ULW6 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc33Q3ULW6 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc33Q3ULW6 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc33Q3ULW6 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc33Q3ULW6 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc33Q3ULW6 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc33Q3ULW6 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc33Q3ULW6 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms